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Ne doit pas être confondu avec exobiologie La xénobiologie est une sous discipline naissante de la biologie de synthèse

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Ne doit pas être confondu avec exobiologie.

La xénobiologie est une sous-discipline naissante de la biologie de synthèse qui vise la mise au point de formes de vie étrangères, du point de vue chimique et informationnel, à celles qui sont connues sur Terre.

Xénobiologie
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Dénominations

Le terme xénobiologie a d'abord été employé en science-fiction pour désigner une possible vie extraterrestre ou son étude scientifique, l'exobiologie, avant que les promoteurs de cette discipline ne se le « réapproprient ».

Les bactéries obtenues par cette technologie sont parfois dites « paranaturelles » et parfois « xénobiotiques ». Ce dernier terme désigne les substances étrangères à un organisme vivant ; un organisme dépendant d'une telle substance met donc en œuvre une chimie différente.

Exemples de manipulation

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La molécule de 5-chloro-uracile.

Philippe Marlière, biologiste, a annoncé le 15 décembre 2010 lors d'une conférence au Génopole d'Évry que, son équipe avait transformé, de façon partielle et réversible, l'ADN de la bactérie Escherichia coli en AXN en remplaçant l'une des bases, la thymine, par un composant artificiel toxique (un xénobiotique), le 5-chloro-uracile.

Ces organismes ont été obtenus dans une « Machine à évoluer » co-inventée avec Rupert Mutzel de l’Université libre de Berlin qui met en œuvre une évolution dirigée dans un dispositif de culture automatisée de cellules soumises à la pression de sélection, contrôlée informatiquement, que constitue une concentration sub-létales du xénobiotique, le 5-chloro-uracile. En 1 000 à 2 000 générations, « les souches cultivées ne demandaient plus de thymine du tout », indique Philipe Marlière qui a abouti à un résidu de 1 % de thymine saupoudré dans le génome des bactéries.

Une nouvelle avancée a été publiée dans Nature en 2014, une équipe américaine étant parvenue à intégrer dans la bactérie Escherichia coli deux nouvelles paires de bases (d5SICS et dNaM). Ces deux bases ont été intégrées dans un plasmide qui a été répliqué au cours de générations successives. Par ailleurs, ces deux bases sont appariées par liaison hydrophobe, contrairement aux bases naturelles, appariées grâce à des liaisons hydrogène.

Il est également possible d'induire des formes de vie où le code génétique est fait de quadruplets et non de triplets, ou qui synthétisent des protéines contenant des acides aminés non standards.

Objectifs et perspectives

Philippe Marlière, par ailleurs industriel, fondateur de la société Isthmus SARL, a pour objectif de produire des agrocarburants et des médicaments grâce à cette Escherichia coli.

Pour Madeleine Bouzon, chercheuse au CEA, la « Machine à évoluer » devrait encore « substituer quatre molécules aux quatre bases de l’ADN » voire de les organiser sur un sucre différent de celui de l'ADN ; c’est l’objectif du programme Xénome (Génopole, CEA et université d'Evry).

L'enrichissement de l'alphabet de l'ADN permet d'envisager une nouvelle étape pour la xénobiologie : l'intégration d'acides aminés xénobiotiques, afin de faire produire par les organismes vivants des protéines aux caractéristiques inédites.

Débats

Philippe Marlière se dit conscient que « cette idée risque d'être difficile à faire passer » dans l'opinion.

Notes et références

  1. Des bactéries avec un ADN jusque-là inconnu sur Terre…
  2. ↑ a b et cLa bactérie « Escherichia coli » peut devenir « paranaturelle », Hervé Morin, Le Monde du 2 juillet 2011
  3. ↑ a et bUne bactérie xénobiotique aiguise les débats sur la biologie synthétique, Libération du 21 septembre 2011
  4. ↑ a et bLe Monde, 18 décembre 2010, page 30.
  5. (en) Philippe Marlièreeno-nucleic acids, « Chemical Evolution of a Bacterium's Genome », Angewandte Chemie International Edition, vol. 50, no 31,‎ 27 juillet 2011, p. 7109-14 (DOI 10.1002/anie.201100535)
  6. A, C, G, ? - Évolution chimique d'un génome bactérien, Communiqué de presse du CNRS du 28 juillet 2011
  7. (en) Malyshev et al., « A semi-synthetic organism with an expanded genetic alphabet », Nature,‎ 7 mai 2014.
  8. ↑ a et b"Deux nouvelles lettres dans l'alphabet de la vie", Hervé Morin, Le Monde du 7 mai 2014
  9. Marie-Neige Cordonnier, « La protéine qui n'existait pas », Pour la science,‎ 8 février 2018(lire en ligne, consulté le 16 février 2018).
  10. (en) Site officiel de l'entreprise
  11. Biocarburants, médicaments, la biologie de synthèse crée des usines vivantes, le 20/06/2011, de goodplanet.info
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Auteur: www.NiNa.Az

Date de publication: 25 Mai, 2025 / 17:30

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Ne doit pas etre confondu avec exobiologie La xenobiologie est une sous discipline naissante de la biologie de synthese qui vise la mise au point de formes de vie etrangeres du point de vue chimique et informationnel a celles qui sont connues sur Terre XenobiologiePartie deBiologie synthetique modifier modifier le code modifier WikidataDenominationsLe terme xenobiologie a d abord ete employe en science fiction pour designer une possible vie extraterrestre ou son etude scientifique l exobiologie avant que les promoteurs de cette discipline ne se le reapproprient Les bacteries obtenues par cette technologie sont parfois dites paranaturelles et parfois xenobiotiques Ce dernier terme designe les substances etrangeres a un organisme vivant un organisme dependant d une telle substance met donc en œuvre une chimie differente Exemples de manipulationLa molecule de 5 chloro uracile Philippe Marliere biologiste a annonce le 15 decembre 2010 lors d une conference au Genopole d Evry que son equipe avait transforme de facon partielle et reversible l ADN de la bacterie Escherichia coli en AXN en remplacant l une des bases la thymine par un composant artificiel toxique un xenobiotique le 5 chloro uracile Ces organismes ont ete obtenus dans une Machine a evoluer co inventee avec Rupert Mutzel de l Universite libre de Berlin qui met en œuvre une evolution dirigee dans un dispositif de culture automatisee de cellules soumises a la pression de selection controlee informatiquement que constitue une concentration sub letales du xenobiotique le 5 chloro uracile En 1 000 a 2 000 generations les souches cultivees ne demandaient plus de thymine du tout indique Philipe Marliere qui a abouti a un residu de 1 de thymine saupoudre dans le genome des bacteries Une nouvelle avancee a ete publiee dans Nature en 2014 une equipe americaine etant parvenue a integrer dans la bacterie Escherichia coli deux nouvelles paires de bases d5SICS et dNaM Ces deux bases ont ete integrees dans un plasmide qui a ete replique au cours de generations successives Par ailleurs ces deux bases sont appariees par liaison hydrophobe contrairement aux bases naturelles appariees grace a des liaisons hydrogene Il est egalement possible d induire des formes de vie ou le code genetique est fait de quadruplets et non de triplets ou qui synthetisent des proteines contenant des acides amines non standards Objectifs et perspectives Philippe Marliere par ailleurs industriel fondateur de la societe Isthmus SARL a pour objectif de produire des agrocarburants et des medicaments grace a cette Escherichia coli Pour Madeleine Bouzon chercheuse au CEA la Machine a evoluer devrait encore substituer quatre molecules aux quatre bases de l ADN voire de les organiser sur un sucre different de celui de l ADN c est l objectif du programme Xenome Genopole CEA et universite d Evry L enrichissement de l alphabet de l ADN permet d envisager une nouvelle etape pour la xenobiologie l integration d acides amines xenobiotiques afin de faire produire par les organismes vivants des proteines aux caracteristiques inedites Debats Philippe Marliere se dit conscient que cette idee risque d etre difficile a faire passer dans l opinion Notes et referencesDes bacteries avec un ADN jusque la inconnu sur Terre a b et c La bacterie Escherichia coli peut devenir paranaturelle Herve Morin Le Monde du 2 juillet 2011 a et b Une bacterie xenobiotique aiguise les debats sur la biologie synthetique Liberation du 21 septembre 2011 a et b Le Monde 18 decembre 2010 page 30 en Philippe Marliereeno nucleic acids Chemical Evolution of a Bacterium s Genome Angewandte Chemie International Edition vol 50 no 31 27 juillet 2011 p 7109 14 DOI 10 1002 anie 201100535 A C G Evolution chimique d un genome bacterien Communique de presse du CNRS du 28 juillet 2011 en Malyshev et al A semi synthetic organism with an expanded genetic alphabet Nature 7 mai 2014 a et b Deux nouvelles lettres dans l alphabet de la vie Herve Morin Le Monde du 7 mai 2014 Marie Neige Cordonnier La proteine qui n existait pas Pour la science 8 fevrier 2018 lire en ligne consulte le 16 fevrier 2018 en Site officiel de l entreprise Biocarburants medicaments la biologie de synthese cree des usines vivantes le 20 06 2011 de goodplanet info Portail de la biologie Portail des technologies

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