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La coproculture du grec ancien κόπρος kópros excrément est la culture bactériologique de selles qui via une coproscopie
Coproculture
La coproculture (du grec ancien : κόπρος / kópros, « excrément ») est la culture bactériologique de selles qui, via une coproscopie, décèle la présence de germes pathogènes normalement absents du tube digestif ou anormalement nombreux.
L'examen peut être utile dans plusieurs cas :
- recherche de bactéries responsables d'une diarrhée,
- recherche d'éventuelles bactéries résistantes chez un patient asymptomatique,
- bilan d'une intoxication alimentaire…
- éventuelle détection d'indice d'une parasitose intestinale
En milieu hospitalier, on peut rechercher, dans les selles, une bactérie d'infection nosocomiale (par exemple, Pseudomonas aeruginosa chez le nouveau-né) ou une souche résistante particulière à un antibiotique.
Il est entièrement non invasif et ne présente aucun risque pour le patient, puisque seules les selles sont échantillonnées et récupérées.
Le but de la coproculture consiste à tenter d'isoler au sein d'une flore complexe un nombre limité d'espèces réputées pathogènes.
Protocole opératoire
- Les selles, en général diarrhéiques, sont prélevées et l'échantillon est placé dans un récipient stérile fermé.
- L'échantillon doit être transporté rapidement en laboratoire, ou conservée dans de la glace en attendant.
- Il est important de signaler si le patient suit un traitement antibiotique ou s'il a récemment effectué un voyage à l'étranger (en particulier en région tropicale).
- L'analyse comportera un examen microscopique direct des selles (à l'état frais ou après coloration, dans le cas de selles liquides, cet examen est important pour orienter les cultures) puis une mise en culture.
À côté de la culture de bactéries classiquement pathogènes, on peut mettre en évidence des toxines dans les selles (produites par Clostridium difficile ou Clostridium perfringens par exemple).
Compte tenu de la diversité des espèces potentiellement responsables, il convient d'orienter la mise en culture selon les différents contextes épidémio-cliniques significatifs (enfant de moins de deux ans, adulte ou enfant de plus de deux ans, voyage en zone tropicale, traitement antibiotique, intoxication alimentaire (suspicion de botulisme, etc.)
- Enfin, un antibiogramme sera effectué, notamment pour Salmonella, Shigella, E. coli et pour V. cholerae en milieu endémique.
Cet examen utile à l'établissement de nombreux diagnostics a l'avantage de pouvoir être pratiqué sans le moindre risque pour le patient car il est non invasif.
Lors de demande de coproculture, recherche systématique de :
- Yersinia
- Shigella
- Salmonella
- Campylobacter
Si suspicion d'autres bactéries (à cause du contexte), il faut demander explicitement au laboratoire de les vérifier aussi (E. coli, Vibrio Cholerae…)
Symptômes et rappels concernant les infections du tube digestif
- Maux de ventre
- Diarrhées
- Vomissements
- Fièvre
Risque de déshydratation si les diarrhées et vomissements sont trop fréquents.
- On va alors rechercher les germes pathogènes stricts ainsi que l'espèce prédominante au sein de la flore variée.
Résultats normaux
La flore colique de l'adulte se caractérise par une grande densité et une extraordinaire diversité.
- Flore normale : 10^12 bactéries/g de selle renfermant plus de 400 espèces différentes.
- flore variée influencée par l'alimentation.
- Équilibre entre bactéries Gram+ et bactéries Gram-
- 90 % sont anaérobies
Flore pathogène
- Bactéries : Vibrio, Clostridium, Escherichia coli . Elles entrent dans le tube digestif, y produisent des toxines et perturbent le bon fonctionnement des entérocytes (cellules de l'intestin)
- Bactéries : dans aliments : Staphylococcus aureus
- Bactéries : dégradent les entérocytes.
- Salmonella
- Shigella
- Campylobacter
- Escherichia coli
- Escherichia coli
- Escherichia coli
- Parasites : Par attachement aux entérocytes
- Giardia lamblia
Voir aussi
Articles connexes
- intestin
- Coproscopie
- intoxication alimentaire
- Matière fécale
- Entérite
- épidémiologie
- Côlon irritable
- Bouse
- Crottin
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- Médecine, médecine vétérinaire
Notes et références
Liens externes
- Ressources relatives à la santé :
- Classification internationale des soins primaires
- Store medisinske leksikon
- Notice dans un dictionnaire ou une encyclopédie généraliste :
- Gran Enciclopèdia Catalana
- Notices d'autorité :
- Japon
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La coproculture du grec ancien kopros kopros excrement est la culture bacteriologique de selles qui via une coproscopie decele la presence de germes pathogenes normalement absents du tube digestif ou anormalement nombreux Nom Coproculture L examen peut etre utile dans plusieurs cas recherche de bacteries responsables d une diarrhee recherche d eventuelles bacteries resistantes chez un patient asymptomatique bilan d une intoxication alimentaire eventuelle detection d indice d une parasitose intestinale En milieu hospitalier on peut rechercher dans les selles une bacterie d infection nosocomiale par exemple Pseudomonas aeruginosa chez le nouveau ne ou une souche resistante particuliere a un antibiotique Il est entierement non invasif et ne presente aucun risque pour le patient puisque seules les selles sont echantillonnees et recuperees Le but de la coproculture consiste a tenter d isoler au sein d une flore complexe un nombre limite d especes reputees pathogenes Protocole operatoireLes selles en general diarrheiques sont prelevees et l echantillon est place dans un recipient sterile ferme L echantillon doit etre transporte rapidement en laboratoire ou conservee dans de la glace en attendant Il est important de signaler si le patient suit un traitement antibiotique ou s il a recemment effectue un voyage a l etranger en particulier en region tropicale L analyse comportera un examen microscopique direct des selles a l etat frais ou apres coloration dans le cas de selles liquides cet examen est important pour orienter les cultures puis une mise en culture A cote de la culture de bacteries classiquement pathogenes on peut mettre en evidence des toxines dans les selles produites par Clostridium difficile ou Clostridium perfringens par exemple Compte tenu de la diversite des especes potentiellement responsables il convient d orienter la mise en culture selon les differents contextes epidemio cliniques significatifs enfant de moins de deux ans adulte ou enfant de plus de deux ans voyage en zone tropicale traitement antibiotique intoxication alimentaire suspicion de botulisme etc Enfin un antibiogramme sera effectue notamment pour Salmonella Shigella E coli et pour V cholerae en milieu endemique Cet examen utile a l etablissement de nombreux diagnostics a l avantage de pouvoir etre pratique sans le moindre risque pour le patient car il est non invasif Lors de demande de coproculture recherche systematique de Yersinia Shigella Salmonella Campylobacter Si suspicion d autres bacteries a cause du contexte il faut demander explicitement au laboratoire de les verifier aussi E coli Vibrio Cholerae Symptomes et rappels concernant les infections du tube digestifMaux de ventre Diarrhees Vomissements Fievre Risque de deshydratation si les diarrhees et vomissements sont trop frequents On va alors rechercher les germes pathogenes stricts ainsi que l espece predominante au sein de la flore variee Resultats normauxLa flore colique de l adulte se caracterise par une grande densite et une extraordinaire diversite Flore normale 10 12 bacteries g de selle renfermant plus de 400 especes differentes flore variee influencee par l alimentation Equilibre entre bacteries Gram et bacteries Gram 90 sont anaerobiesFlore pathogeneBacteries Vibrio Clostridium Escherichia coli Elles entrent dans le tube digestif y produisent des toxines et perturbent le bon fonctionnement des enterocytes cellules de l intestin Bacteries dans aliments Staphylococcus aureus Bacteries degradent les enterocytes Salmonella Shigella Campylobacter Escherichia coli Escherichia coli Escherichia coli Parasites Par attachement aux enterocytes Giardia lambliaVoir aussiArticles connexes intestin Coproscopie intoxication alimentaire Matiere fecale Enterite epidemiologie Colon irritable Bouse Crottin Medecine medecine veterinaire Notes et referencesLiens externesRessources relatives a la sante Classification internationale des soins primaires Store medisinske leksikon Notice dans un dictionnaire ou une encyclopedie generaliste Gran Enciclopedia Catalana Notices d autorite JaponPortail de la microbiologie Portail de la medecine