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Cet article est une ébauche concernant la microbiologie Les Eubacteriales anciennement Clostridiales sont un ordre de ba
Eubacteriales
Cet article est une ébauche concernant la microbiologie.
Les Eubacteriales – anciennement Clostridiales – sont un ordre de bactéries contenant un mélange d'organismes Gram positifs et Gram négatifs de la classe des Clostridia. Son nom provient d’ qui est le genre type de cet ordre.
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Bacillota |
| Classe | Clostridia |
Ordre
1917
(Approved Lists 1980)
Synonymes
- Desulfotomaculales Watanabe et al. 2019
- Heliobacteriales Cavalier-Smith 2006
- Clostridiales Prévot 1953
Taxonomie
Cet ordre est décrit dès 1917 par . Il est longtemps distinct de l'ordre des Clostridiales proposé en 1953 par A.R. Prévot. Les deux ordres sont validés en 1980 par leur intégration aux Approved Lists of Bacterial Names publiées dans l'IJSEM.
En 2018, X. Zhang et al. créent la famille des par reclassement de plusieurs espèces de l'ordre des Clostridiales formant un taxon décrit comme monophylétique. L'année suivante, B.J. Tindall rapporte les conséquences de cette création sur la nomenclature d'après les règles de l'ICSP. Zhang et al. ont placé dans le même ordre qu'ils nomment encore « Clostridiales » les espèces Clostridium butyricum – espèce type du genre Clostridium – et – type du genre . Cela conduit à considérer comme des synonymes hétérotypiques les ordres dont ces genres sont eux-mêmes les genres types, à savoir Clostridiales et Eubacteriales (règle n°24a du code de nomenclature bactérienne). Le nom retenu pour le taxon dans lequel ils sont réunis est déterminé par l'ordre de publication des deux noms (règles n°24b(1) et 38 du même code). L'auteur conclut que, Eubacteriales Buchanan 1917 étant antérieur à Clostridiales Prévot 1953, c'est le premier nom qui doit être retenu. Ce raisonnement est validé par la LPSN (7 décembre 2022) qui présente Eubacteriales comme le nom correct et Clostridiales comme un synonyme.
Liste des familles
Familles validement publiées
Selon la LPSN (7 décembre 2022) :
- Yokoyama et al. 2010
- Morotomi et al. 2012
- Clostridiaceae Pribram 1933
- Jabari et al. 2012
- Stackebrandt 2020
- Ludwig et al. 2010
- Lee et al. 2010
- Madigan & Asao 2010
- Lachnospiraceae Rainey 2010
- Peshkoff 1940
- Rogosa 1971
- Peptoniphilaceae Johnson et al. 2014
- Peptostreptococcaceae Ezaki 2010
- corrig. Kevbrin et al. 2014
- Symbiobacteriaceae Shiratori-Takano et al. 2014
- Zhao et al. 1993
- Quéméneur et al. 2019
- Liu et al. 2020
Familles en attente de publication valide
Selon la LPSN (7 décembre 2022) les familles suivantes sont en attente de publication valide (Ca. signifie Candidatus) :
- « » Molisch 1907
- « » Jones et al. 2019
- « » Rahn 1937
- « » Orla-Jensen 1921
- « » Wylensek et al. 2020
- « » Rahn 1937
- « » Afrizal et al. 2022
Notes et références
- Buchanan RE « Studies on the Nomenclature and Classification of the Bacteria: III. The Families of the Eubacteriales » J Bacteriol. 1917;2(4):347-350. Accès libre.
- Prévot AR « B. » In : Hauduroy P, Ehringer G, Guillot G, Magrou J, Prévot AR, Rosset, Urbain A (eds) Dictionnaire des bactéries pathogènes : pour l'homme, les animaux et les plantes. 2ème édition. Masson, Paris, 1953.
- Skerman VBD, McGowan V & Sneath PHA « Approved Lists of Bacterial Names » Int J Syst Bacteriol. 1980;30(1):225-420. Accès libre.
- Zhang X et al. « Petroclostridium xylanilyticum gen. nov., sp. nov., a xylan-degrading bacterium isolated from an oilfield, and reclassification of clostridial cluster III members into four novel genera in a new Hungateiclostridiaceae fam. nov. » Int J Syst Evol Microbiol. 2018;68(10):3197-3211. Accès libre.
- Tindall BJ « The names Hungateiclostridium Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium thermocellum (Viljoen et al. 1926) Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium cellulolyticum (Patel et al. 1980) Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium aldrichii (Yang et al. 1990) Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium alkalicellulosi (Zhilina et al. 2006) Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium clariflavum (Shiratori et al. 2009) Zhang et al. 2018, Hungateiclostridium straminisolvens (Kato et al. 2004) Zhang et al. 2018 and Hungateiclostridium saccincola (Koeck et al. 2016) Zhang et al. 2018 contravene Rule 51b of the International Code of Nomenclature of Prokaryotes and require replacement names in the genus Acetivibrio Patel et al. 1980 » Int J Syst Evol Microbiol. 2019;69(12):3927-3932. Accès libre.
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 7 décembre 2022.
Liens externes
- (en) NCBI : Clostridiales (taxons inclus)
- (en) Tree of Life Web Project : Clostridiales
- (en) Catalogue of Life : Clostridiales Prévot, 1953 (consulté le )
- (en) WoRMS : Clostridiales (+ liste espèces)
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Auteur: www.NiNa.Az
Date de publication:
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Cet article est une ebauche concernant la microbiologie Les Eubacteriales anciennement Clostridiales sont un ordre de bacteries contenant un melange d organismes Gram positifs et Gram negatifs de la classe des Clostridia Son nom provient d qui est le genre type de cet ordre Eubacteriales C botulinum microscopie optique apres coloration au violet de gentiane montrant les spores est une espece de l ordre des EubacterialesClassification LPSNDomaine BacteriaEmbranchement BacillotaClasse Clostridia OrdreEubacteriales 1917 Approved Lists 1980 Synonymes Desulfotomaculales Watanabe et al 2019 Heliobacteriales Cavalier Smith 2006 Clostridiales Prevot 1953TaxonomieCet ordre est decrit des 1917 par Il est longtemps distinct de l ordre des Clostridiales propose en 1953 par A R Prevot Les deux ordres sont valides en 1980 par leur integration aux Approved Lists of Bacterial Names publiees dans l IJSEM En 2018 X Zhang et al creent la famille des par reclassement de plusieurs especes de l ordre des Clostridiales formant un taxon decrit comme monophyletique L annee suivante B J Tindall rapporte les consequences de cette creation sur la nomenclature d apres les regles de l ICSP Zhang et al ont place dans le meme ordre qu ils nomment encore Clostridiales les especes Clostridium butyricum espece type du genre Clostridium et type du genre Cela conduit a considerer comme des synonymes heterotypiques les ordres dont ces genres sont eux memes les genres types a savoir Clostridiales et Eubacteriales regle n 24a du code de nomenclature bacterienne Le nom retenu pour le taxon dans lequel ils sont reunis est determine par l ordre de publication des deux noms regles n 24b 1 et 38 du meme code L auteur conclut que Eubacteriales Buchanan 1917 etant anterieur a ClostridialesPrevot 1953 c est le premier nom qui doit etre retenu Ce raisonnement est valide par la LPSN 7 decembre 2022 qui presente Eubacteriales comme le nom correct et Clostridiales comme un synonyme Liste des famillesFamilles validement publiees Selon la LPSN 7 decembre 2022 Yokoyama et al 2010 Morotomi et al 2012 Clostridiaceae Pribram 1933 Jabari et al 2012 Stackebrandt 2020 Ludwig et al 2010 Lee et al 2010 Madigan amp Asao 2010 Lachnospiraceae Rainey 2010 Peshkoff 1940 Rogosa 1971 Peptoniphilaceae Johnson et al 2014 Peptostreptococcaceae Ezaki 2010 corrig Kevbrin et al 2014 Symbiobacteriaceae Shiratori Takano et al 2014 Zhao et al 1993 Quemeneur et al 2019 Liu et al 2020 Familles en attente de publication valide Selon la LPSN 7 decembre 2022 les familles suivantes sont en attente de publication valide Ca signifie Candidatus Molisch 1907 Jones et al 2019 Rahn 1937 Orla Jensen 1921 Wylensek et al 2020 Rahn 1937 Afrizal et al 2022Notes et references a et b Buchanan RE Studies on the Nomenclature and Classification of the Bacteria III The Families of the Eubacteriales J Bacteriol 1917 2 4 347 350 Acces libre Prevot AR B In Hauduroy P Ehringer G Guillot G Magrou J Prevot AR Rosset Urbain A eds Dictionnaire des bacteries pathogenes pour l homme les animaux et les plantes 2eme edition Masson Paris 1953 Skerman VBD McGowan V amp Sneath PHA Approved Lists of Bacterial Names Int J Syst Bacteriol 1980 30 1 225 420 Acces libre Zhang X et al Petroclostridium xylanilyticum gen nov sp nov a xylan degrading bacterium isolated from an oilfield and reclassification of clostridial cluster III members into four novel genera in a new Hungateiclostridiaceae fam nov Int J Syst Evol Microbiol 2018 68 10 3197 3211 Acces libre Tindall BJ The names Hungateiclostridium Zhang et al 2018 Hungateiclostridium thermocellum Viljoen et al 1926 Zhang et al 2018 Hungateiclostridium cellulolyticum Patel et al 1980 Zhang et al 2018 Hungateiclostridium aldrichii Yang et al 1990 Zhang et al 2018 Hungateiclostridium alkalicellulosi Zhilina et al 2006 Zhang et al 2018 Hungateiclostridium clariflavum Shiratori et al 2009 Zhang et al 2018 Hungateiclostridium straminisolvens Kato et al 2004 Zhang et al 2018 and Hungateiclostridium saccincola Koeck et al 2016 Zhang et al 2018 contravene Rule 51b of the International Code of Nomenclature of Prokaryotes and require replacement names in the genus Acetivibrio Patel et al 1980 Int J Syst Evol Microbiol 2019 69 12 3927 3932 Acces libre a b et c List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature LPSN consulte le 7 decembre 2022 Sur les autres projets Wikimedia Eubacteriales sur Wikimedia CommonsEubacteriales sur WikispeciesLiens externes en NCBI Clostridiales taxons inclus en Tree of Life Web Project Clostridiales en Catalogue of Life Clostridiales Prevot 1953 consulte le 11 decembre 2020 en WoRMS Clostridiales liste especes Portail de la microbiologie