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Biologie

La biologie (du grec bios « la vie » et logos, « discours ») est la science du vivant. Elle recouvre une partie des sciences de la nature et de l'histoire naturelle des êtres vivants.

Partie de | Science de la nature |
---|---|
Pratiqué par | Biologiste, étudiant ou étudiante en biologie (d) |
Champs | Morphologie écologie botanique zoologie archéobiologie anatomie mycologie génétique biologie des couleurs (d) biologie cellulaire biologie de l'évolution biologie computationnelle neurobiologie (d) microbiologie biotechnologie biochimie biophysique |
Objets | Vie organisme |
Histoire | Histoire de la biologie |
La vie se présentant sous de nombreuses formes et à des échelles très différentes, la biologie s'étend du niveau moléculaire, à celui de la cellule, puis de l'organisme, jusqu'au niveau de la population et de l'écosystème.
Étymologie

Le terme biologie est formé par la composition des deux mots grecs βίος / bios, « vie », et λόγος / lógos, « discours, parole »,.
Ce néologisme est créé à la fin du XVIIIe siècle et au début du XIXe siècle, de façon indépendante :
- en allemand par Theodor Georg August Roose en 1797, Karl Friedrich Burdach en 1800 et Gottfried Reinhold Treviranus dans son ouvrage Biologie oder Philosophie der lebenden Natur, publié à Göttingen en 1804 ;
- en français par le naturaliste français Jean-Baptiste de Lamarck dans ses Recherches sur l’organisation des corps vivants en 1802 :
« Tout ce qui est généralement commun aux végétaux et aux animaux comme toutes les facultés qui sont propres à chacun de ces êtres sans exception, doit constituer l'unique et vaste objet d'une science particulière qui n'est pas encore fondée, qui n'a même pas de nom, et à laquelle je donnerai le nom de biologie. »
Chez Lamarck on trouve, pour la première fois, une conception de l'être vivant qui reconnaît son originalité, comparativement aux objets inanimés sans pour autant la faire déroger aux lois de la physique, contrairement à ce qu'avaient tendance à faire les vitalistes et les fixistes.
Le même Lamarck, bien avant de donner des cours de biologie en 1819, sépare dans son ouvrage Hydrogéologie, paru également en 1802, la physique terrestre en trois parties :
- la météorologie (étude de l'atmosphère) ;
- l'hydrogéologie (étude de la croûte minérale) ;
- la biologie (étude des corps vivants).
Les savants allemands, à l'appel de Treviranus, lancent les méticuleux inventaires de la flore et de la faune, réalisés par ceux qui, respectivement, se nommeront botanistes et zoologistes. Vers le milieu du XIXe siècle, un intérêt pour les fonctions du vivant oriente la recherche biologique vers la physiologie.
Histoire
Principes fondateurs
Définition de l'objet
Définir la vie
L'objet de la biologie est l'être vivant et la vie, dans son ensemble et son fonctionnement. Mais qu'est-ce qu'un être vivant ? En quoi se différencie-t-il des objets inanimés et des machines ? Et qu'est-ce que la vie ? À ces questions, les biologistes n'ont actuellement pas de réponse précise, qui fasse l'unanimité dans la communauté scientifique. Certains d'entre eux pensent même que ces questions sont sans objet.
Ainsi en 1878 Claude Bernard, dans la première des Leçons sur les phénomènes de la vie communs aux animaux et aux végétaux, déclare explicitement « on peut caractériser la vie, mais non la définir », car la biologie doit être une science expérimentale ; ce serait là une définition a priori et « la méthode qui consiste à définir et à tout déduire d'une définition peut convenir aux sciences de l'esprit, mais elle est contraire à l'esprit même des sciences expérimentales ». En conséquence, « il suffit que l'on s'entende sur le mot vie pour l'employer » et « il est illusoire et chimérique, contraire à l'esprit même de la science, d'en chercher une définition absolue ».
La biologie semble être restée fidèle à cette conception, puisqu'elle continue à ne pas précisément définir la notion de vie pour se limiter à l'analyse de « choses naturelles » ou parfois en partie créées par l'humain (via la sélection puis le génie génétique) que le sens commun lui désigne comme vivants. Cette analyse permet de mettre en évidence un certain nombre de caractères communs à ces objets d'étude, et ainsi d'appliquer ce qualificatif de vivant à d'autres objets présentant les mêmes caractères. Cette méthode, exclusivement analytique et expérimentale, a considérablement renforcé l'efficacité et la scientificité du travail du biologiste, comparativement aux conceptions souvent spéculatives d'avant Claude Bernard. Elle a cependant amené une « physicalisation » telle que l'on a parfois l'impression que, pour rendre scientifique la biologie, il a fallu nier toute spécificité à son objet.
De fait, certains biologistes en viennent à déclarer que « la vie n'existe pas ! », ou plus exactement qu'elle serait un processus physico-chimique parmi d'autres.
Le premier d’entre eux est probablement Albert Szent-Györgyi, prix Nobel de médecine en 1937, qui a déclaré :
« La vie en tant que telle n’existe pas, personne ne l’a jamais vue. »
Le plus connu est François Jacob :
« On n'interroge plus la vie aujourd'hui dans les laboratoires. On ne cherche plus à en cerner les contours. […] C'est aux algorithmes du monde vivant que s'intéresse aujourd'hui la biologie. »
Plus récemment, c'est aussi la position d'Henri Atlan :
« L’objet de la biologie est physico-chimique. À partir du moment où l’on fait de la biochimie et de la biophysique, et où l’on comprend les mécanismes physico-chimiques qui rendent compte des propriétés des êtres vivants, alors la vie s’évanouit ! Aujourd’hui, un biologiste moléculaire n’a pas à utiliser pour son travail le mot « vie ». Cela s’explique historiquement : il s’occupe d’une chimie qui existe dans la nature, dans un certain nombre de systèmes physico-chimiques particuliers, aux propriétés spécifiques, et appelés animaux ou plantes, c’est tout ! »
Cette dernière citation illustre la confusion entre l'étude de la vie et celle de la matière des êtres vivants, où transparaît la tentation de réduire la biologie à la seule biologie moléculaire en niant au vivant, grâce au nivellement que permet la chimie, toute spécificité qui ne soit pas une simple différence physico-chimique. Autrement dit, il est tentant, en réduisant la biologie à la biologie moléculaire, de ne différencier le vivant de l'inanimé que par les critères par lesquels la biologie moléculaire se différencie du reste de la chimie.
Vivant et inanimé
André Pichot affirme que « Cette négation de la spécificité du vivant pourrait venir d'une conception où l'on n'admet aucune discontinuité entre vivant et inanimé pour conserver un univers cohérent et unifié ». On peut y admettre une gradation progressive entre l'inanimé et le vivant, tant dans les formes actuelles (les virus, censés être à la limite du vivant et de l'inanimé) que dans l'apparition de la vie sur Terre (cette apparition y est comprise comme une phase prébiotique progressive sans discontinuité marquée).
Cette « négation de la spécificité du vivant », qui se veut matérialiste, semble confondre simplement le matérialisme épistémologique (l'étude critique des sciences) et les sciences de la matière proprement dites.
En biologie, tenter d'expliquer la notion de vie et la spécificité de l'être vivant, peut conduire aux notions de vitalisme ou même d'animisme, car en s'écartant un peu de la physico-chimie on peut sortir du matérialisme épistémologique. Si bien qu'aujourd'hui « on a l'impression que ce que vise la biologie n'est pas tant l'étude de la vie (ou de l'être vivant dans ce qu'il a de spécifique relativement à l'objet inanimé) que sa pure et simple négation, le nivellement et l'unification de l'univers par la physico-chimie. Comme si, pour unifier, il valait mieux nier les solutions de continuité que les comprendre ».
Une autre approche, plus systémique, est ainsi résumée en 1970 par François Jacob : « Tout objet que considère la Biologie représente un système de systèmes; lui - même élément d'un système d'ordre supérieur, il obéit parfois à des règles qui ne peuvent être déduites de sa propre analyse » ; c'est une des bases de l'écologie scientifique et de son « approche écosystémique ».
Le problème de la spécificité de l'être vivant n'est donc pas encore réglé par la biologie moderne qui ainsi n'a donc aucune définition claire et explicite de son objet. Ce problème est seulement occulté de diverses manières, qui toutes tendent à ramener, faute de mieux, la conception de Descartes de l'être vivant comme plus ou moins semblable à une machine très complexe.
Rares sont les biologistes qui s'inscrivent en faux contre cette approximation en avançant une conception du vivant plus précise, visant à se rapprocher de la réalité,. Un certain nombre de travaux en biologie théorique tentent en effet de dépasser les limitations auxquelles on s'est heurtées jusqu'à présent, tels que ceux de Francisco Varela, Robert Rosen ou Stuart Kauffman. L'enjeu est alors souvent de tenter d'appréhender les différences entre biologie et physique.
Évolution


La première théorie de l'évolution du vivant a été avancée par Jean-Baptiste Lamarck dans son ouvrage Philosophie Zoologique en 1809. Comme son titre l'indique, elle se présente sous la forme d'un système philosophique, bien qu'elle pose les bases essentielles pour la compréhension des êtres vivants et de leur évolution. Cinquante ans plus tard, en 1859, avec la parution de L'Origine des espèces, Charles Darwin propose une explication scientifique de l'évolution, sous la forme d'un mécanisme simple, avec le principe de sélection naturelle. Avec le temps, la théorie originelle de Darwin a été affinée avec les résultats des expériences et observations que les biologistes ont effectuées. La théorie faisant actuellement consensus est celle de la théorie synthétique de l'évolution, appelée aussi néodarwinisme.
Le caractère évolutionniste de la vie a pendant très longtemps été discuté et est même encore mis en doute par certaines personnes en dehors de la communauté scientifique, mais aucune de ces objections à la théorie de l'évolution n'est scientifiquement fondée. La communauté scientifique a depuis très largement admis l'évolutionnisme de la vie comme un fait démontré par l'expérience et l'observation à maintes reprises notamment par :
- l'examen des fossiles en paléontologie qui montre l'évolution des formes de vie à travers le temps ;
- l'anatomie comparée qui met en évidence les similitudes morphologiques entre des animaux pourtant différents ;
- l'hérédité qui explique les variations génétiques d'une génération à une autre ;
- l'étude comparée du génome de plusieurs organismes qui montre l'éloignement plus ou moins important dans l'arbre phylogénétique, permettant ainsi de retracer l'évolution et l'éloignement des différentes formes de vie ;
- la culture sélective des plantes et la domestication des animaux sont la mise en application par les humains du principe de sélection naturelle.
Diversité
Si la biologie est si vaste, c'est en raison de l'extrême diversité du vivant qui se présente sous tellement de formes que l'on peut avoir du mal à discerner des points communs. Une hiérarchisation du vivant a tout de même été réalisée, qui est le domaine de la systématique et de la taxinomie. Tous les êtres vivants sont classés en trois domaines :
- les bactéries ;
- les archées ;
- les eucaryotes.
Universalité

Bien qu'étant différentes, toutes les formes de vie partagent des caractères communs. Ce qui porte à croire que la vie sur Terre a pour origine une seule et même forme de vie, désignée sous l'acronyme de LUCA (pour l'anglais : Last universal common ancestor), qui serait apparue sur Terre il y a au moins 2,5 milliards d'années.
Les principaux caractères universels du vivant sont :
- le carbone qui, par ses caractéristiques physiques, sert de « squelette » à tous les composés organiques ;
- l'ADN et l'ARN, qui servent de support au génome et assurent la transmission de ce dernier à la descendance lors de la reproduction ;
- la cellule qui est la plus petite unité vivante. Ce dernier point est discuté au sein de la communauté scientifique, car les virus sont considérés comme vivants par certains biologistes, alors qu'ils ne sont pas faits de cellules.
Domaines d'études
En raison du caractère extrêmement vaste du sujet, l'étude de la biologie nécessite un morcellement en domaines d'études. Une approche un peu « réductrice » mais ayant l'avantage de clarifier les thèmes consiste à définir des niveaux d'organisation. Dans un souci de parvenir à une compréhension plus globale de la biologie, des ponts se sont naturellement créés entre les différentes disciplines. Permet l'exploration de différents sujets originaux comme la biologie moléculaire, la biotechnologie, la toxicologie, la science biomédicale, etc.
Structure du vivant

Les domaines étudiant la structure du vivant sont à l'échelle de l'atome pour la biologie moléculaire et de la cellule pour la biologie cellulaire.
Le domaine de la biologie moléculaire étudie les composés de bases du vivant, comme l'ADN et les protéines. Pendant longtemps, on a cru que les lois de la chimie régissant le vivant étaient différentes de celles pour la matière inanimée. Mais depuis la synthèse de nombreux composés organiques, il est clairement admis que les lois chimiques sont les mêmes que pour la matière inorganique. Aucune force vitale n'insuffle la vie à la matière comme on le pensait avant avec la théorie vitaliste.
La mise au point du microscope avec lequel Robert Hooke a découvert les cellules en 1665 a marqué la naissance de la biologie cellulaire et celle d'un monde alors insoupçonné. Cette découverte et les nombreuses qui ont suivi ont permis d'expliquer certains phénomènes comme ce que l'on qualifiait à l'époque de génération spontanée. C'est à cette échelle que l'on rencontre les premiers organismes vivants.
Anatomie et physiologie

Prise au sens structurelle et fonctionnelle, la biologie recouvre également l'ensemble des disciplines, classiques et modernes, qui étudient des structures comme les tissus avec l'histologie ou les organes avec l'anatomie. La physiologie quant à elle étudie les principes mécaniques, physiques et biochimiques des organismes vivants et est séparée en deux branches : la physiologie végétale et la physiologie animale.
Diversité et évolution

L'extrême diversité du vivant n'empêche en rien le groupement en entités ou taxons (Taxinomie), leurs relations les uns par rapport aux autres et leur classement (systématique).
Interactions
Les interactions des êtres vivants entre eux et les liens les unissant avec leur environnement est le domaine de l'écologie. L'éthologie quant à elle étudie le comportement animal dans le milieu naturel.
Niveaux d'observation et disciplines
Les Sciences de la Vie comprennent de nombreuses disciplines et sous-disciplines plus ou moins reliées entre elles et parfois imbriquées. Ces disciplines sont organisées soit par niveau d'observation, soit par approche méthodologique, soit par type d'organisme étudié.
Niveau d'observation | Exemple | Disciplines |
---|---|---|
moléculaire | molécules biologiques : protéines, ADN, ARN | chimie organique, biochimie, biologie moléculaire |
microscopique | composants de la cellule (organites) | biologie cellulaire, cytologie |
cellules, organismes unicellulaires | microbiologie | |
tissus | histologie | |
organes | physiologie | |
macroscopique | organismes, individus | biologie des organismes, anatomie, éthologie |
populationnel | colonies, populations, métapopulations | biologie des populations, génétique des populations |
spécifique | espèce | taxinomie, phylogéographie, etc. |
supra-spécifique | groupes d'espèces, écosystèmes, évolution humaine | systématique, écologie, phylogénie |
Applications

Les applications des découvertes en biologie sont nombreuses et très présentes dans le quotidien de l'être humain. Les avancées importantes de ces dernières décennies en médecine ont principalement pour origine les découvertes sur le fonctionnement du corps humain. Le domaine pharmaceutique profite également des avancées en chimie organique.
Plus récemment, la découverte de la structure de l'ADN et une meilleure compréhension de l'hérédité ont permis de modifier finement les êtres vivants, par notamment les techniques de génie génétique, et trouvent des applications dans les domaines agricole et agro-alimentaire.
La biologie peut également avoir des applications en criminologie. Dans la Revue française de criminologie et de droit pénal, Laurent Lemasson présente trois corrélations entre biologie et criminalité mises en évidence par différents chercheurs: la présence des gènes MAOA et HTR2B chez une part importante de criminels ; un fonctionnement anormal des régions frontales et temporales du cerveau ; enfin un état de sous-excitation physiologique chez les criminels multirécidivistes.
Impacts sur la société
Depuis le développement de la biologie moléculaire et de la physiologie cellulaire dans la seconde partie du XXe siècle, les progrès de la biologie sont devenus quotidiens et ont un impact énorme sur la société : compréhension des mécanismes moléculaires de plusieurs centaines de maladies, amélioration des traitements contre le cancer, compréhension des mécanismes neurologiques, amélioration des traitements des maladies mentales et dépistage de tares génétiques in utero. Une meilleure compréhension de l'évolution moléculaire, substrat physique à l'évolution des espèces, permet de transposer aux humains les découvertes faites sur les animaux, y compris des vers comme C. elegans ou la mouche drosophile, dont on a montré que les mécanismes moléculaires de segmentation du corps au cours de l'embryogenèse sont identiques à ceux de l'humain, et, de manière générale, à tout le vivant métazoaire.
Toutefois, les progrès très rapides de la biologie suscitent parfois des interrogations philosophiques, de vives inquiétudes, voire une forte opposition de certaines associations ou organisations non gouvernementales (ONG). On peut citer notamment : le clonage, les organismes génétiquement modifiés (OGM), le séquençage, et les problèmes de propriété intellectuelle qui en découlent.
- Animalia - Bos primigenius taurus.
- Planta - Triticum.
- Fungi - Morchella esculenta.
- Stramenopila/Chromista - Fucus serratus.
- Bacteria - Gemmatimonas aurantiaca (- = 1 Micrometer).
- Archaea - Halobacteria.
- Virus - Gamma phage.
Notes et références
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- « Logos et Biologie. Étymologie et historique », Portail lexical du CNRTL en ligne.
- Prs Geerinck et Balleux, Répertoire des racines d'origine hellénique, utilisées dans la terminologie des sciences biologiques. Biologie à l'Athénée Fernand Blum, sur afblum.be (consulté le 1er septembre 2014).
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- Erwin Schrödinger, Qu'est-ce que la vie ?, 1944.
- [Leçons sur les phénomènes de la vie communs aux animaux et aux végétaux. Première leçon, 1878 : lire en ligne
- 1948 ; cité par Henri Atlan, 1994.
- François Jacob, La Logique du vivant, une histoire de l’hérédité, 1970, p. 321.
- Henri Atlan, Question de vie, éd. Seuil, 1994, p. 43-44.
- André Pichot. Histoire de la notion de vie, éd. Gallimard, coll. « Tel », 1993 : lire concluion en cligne
- François Jacob, La logique du vivant, une histoire de l’hérédité, coll. « Tel », 1re éd., 1970, éditions Gallimard, Paris, 1987, 356 p. (ISBN 978-2-07-029334-6)
- Gérard Nissim Amzallag, L'homme végétal, pour une autonomie du vivant, 2002
- (en) Giuseppe Longo, Maël Montévil et Stuart Kauffman, « No Entailing Laws, but Enablement in the Evolution of the Biosphere », Proceedings of the 14th Annual Conference Companion on Genetic and Evolutionary Computation, ACM, gECCO '12, , p. 1379–1392 (ISBN 9781450311786, DOI 10.1145/2330784.2330946, lire en ligne, consulté le ).
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Voir aussi
Bibliographie
Introduction à la biologie : dictionnaire, traité, présentation générale, réflexion
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- Jean-Louis Morère, Raymond Pujol, Dictionnaire raisonné de biologie, éditions Frison-Roche, Paris, 2003, 1222 p. Préface de Jean Dorst et Yves Coppens (ISBN 978-2-87671-300-0)
- William K. Purves, Gordon H. Orians, H. Craig Heller, Traité de Biologie, Sciences Flammarion, Paris, 1994, 1224 p. Traduction par Jacqueline London de Life: The science of biology, 3e éd., Sinauer associates, Sunderland, Massachusetts, 1992 (ISBN 978-2-257-15025-7)
- (en) (de), General Microbiology, Seventh Edition, Cambridge University Press, 1992, 656 p. Translation of Allgemeine Mikrobiologie, Georg Thieme Verlag, Stuttgart, 1969-1992, by Margot Kogut (ISBN 978-0-521-43980-0)
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- Günther Vogel, Hartmunt Angermann, Atlas de la biologie, Encyclopédie d’aujourd’hui, La Pochothèque, Le livre de poche, 1994, 641 p. Adaptation du dtv-Atlas zur Biologie, zweite Verfassung, Deutsche Taschenbuch Verlag, München, 1984, sous la direction de Georges Carric. La première adaptation scientifique de l’édition 1970 est dirigée par le biologiste généticien Matthieu Ricard avec Michel Stephan, Élisabeth Loubet, Jean-Pierre Bobillot, Dominique Marie, Alain Saint-Dizier et la traduction de Anne Sebisch, Michel Brottier et Claude Sebisch (ISBN 978-2-253-06451-0)
- Le livre de la vie, sous la direction de Stephen Jay Gould, textes de Peter Andrews, Michael Benton, Christine Janis, J. John Sepkoski, Christopher Stringer, dessins de John Barber, Marianne Collins, Ely Kish, Akio Morishima, Jean-Paul Tibbles, coll. « science ouverte », Seuil, Paris, 1993, 256 p. Traduit de l’anglais par Marcel Blanc (ISBN 978-2-02-019988-9)
- Guillaume Lecointre (dir.), Guide critique de l’évolution, Belin, Paris, 2009, 504 p. (ISBN 978-2-7011-4797-0)
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- Patrick Tort, Dictionnaire du darwinisme et de l’évolution (dir.), Paris, PUF, 1996, 3 vol., 5000 p. Ouvrage couronné par l’Académie des sciences.
- Peter Hamilton Raven, Georges Brooks Johnson, Kenneth A. Mason, Jonathan B. Losos et Susan R. Singer (trad. Jules Bouharmont), Biologie, De Boeck Supérieur, (1re éd. 2007), 1400 p. (lire en ligne)
- Tania Louis, Agatha Liévin-Bazin et Éléa Heberle, La battle du vivant, Paris, De Boeck Supérieur, (1re éd. 2024), 168 p. (ISBN 978-2-8073-4539-3, lire en ligne)
Botanique
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- Gaston Bonnier, Les noms de fleurs trouvés par la méthode simple, Librairie générale de l’enseignement, Paris, 1971, 338 p.
- Dietmar Aichelé, Quelle est donc cette fleur ?, éditions Fernand Nathan, Paris, 1975, 400 p. Illustrations de Marianne Golte-Bechtle. Traduction par Thomas Althaus de Was blüht denn da ?, Frankh’sche Verlagshandlung, Kosmos Verlag, Stuttgart, 1973.
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- Marcel Bournérias, Christian Bock, Le Génie végétal, Nathan, Paris, 1992, 232 p. (ISBN 978-2-09-241040-0)
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- Suzanne Amigues, Études de botanique antique, préface de Pierre Quézel. Paris, de Boccard, 2002, XV-501 p.
Espèces animales
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- René Jeannel, « Introduction à l’entomologie » in Nouvel atlas d’entomologie, éditions N. Boubée & Cie, 1960.
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- Lars Svensson, Peter J. Grant pour les textes, Dan Zetterström, Kilian Mullarney pour les illustrations, Le guide ornitho, les 848 espèces d’Europe en 4 000 dessins, coll. « Les guides du naturaliste », Delachaux et niestlé, Paris, 2000, 400 p. Traduction de l’ouvrage suédois Faogel guiden, Europas och Medelhavsomraodets faoglar i fält, Albert Bonniers, Förlag, Stockholm, 1999 par Jean-Louis Parmentier avec adaptation et supervision scientifique de Guilhem Lesaffre (ISBN 978-2-603-01142-3)
- Louis Chaix, Patrice Méniel, Archéozoologie, les animaux et l’archéologie, coll. « des Hespérides », éditions Errance, Paris, 2001, 240 p. (ISBN 978-2-87772-218-6)
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Écologie et milieux
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- Gunnar Thorson, La vie dans la mer, coll. « L’Univers des connaissances », Hachette, Paris, 1971, 256 p. Texte français de Georges H. Gallet.
- Bernard Boullard, Guerre et paix dans le règne végétal, Ellipses, Aubin Imprimeur, Paris, 1990, 336 p. (ISBN 978-2-7298-9033-9)
- Claude Leroy, La forêt redécouverte, Belin, Paris, août 2009, 732 p. (ISBN 978-2-7011-4886-1)
Biogéographie et culture botanique
- Paul Ozenda, Végétation du continent européen, Delachaux et Niestlé, Lausanne /Paris, 1994, 272 p. (ISBN 978-2-603-00954-3)
- François Couplan, Ce sont les plantes qui sauvent, ma botanique gourmande, récit, Plon, Paris, 2005, 462 p. (ISBN 978-2-259-19670-3)
- Gérard Debuigne, François Couplan, Petit Larousse des plantes qui guérissent, 500 plantes, édition Larousse 2006, 896 p. (ISBN 978-2-03-582256-7)
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Initiation à la biophysique et biologie humaine
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Articles connexes
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Pour les articles homonymes voir Bio La biologie du grec bios la vie et logos discours est la science du vivant Elle recouvre une partie des sciences de la nature et de l histoire naturelle des etres vivants BiologiePartie deScience de la naturePratique parBiologiste etudiant ou etudiante en biologie d ChampsMorphologie ecologie botanique zoologie archeobiologie anatomie mycologie genetique biologie des couleurs d biologie cellulaire biologie de l evolution biologie computationnelle neurobiologie d microbiologie biotechnologie biochimie biophysiqueObjetsVie organismeHistoireHistoire de la biologie modifier modifier le code modifier Wikidata La vie se presentant sous de nombreuses formes et a des echelles tres differentes la biologie s etend du niveau moleculaire a celui de la cellule puis de l organisme jusqu au niveau de la population et de l ecosysteme EtymologiePortrait de Jean Baptiste Lamarck 1893 Le terme biologie est forme par la composition des deux mots grecs bios bios vie et logos logos discours parole Ce neologisme est cree a la fin du XVIII e siecle et au debut du XIX e siecle de facon independante en allemand par Theodor Georg August Roose en 1797 Karl Friedrich Burdach en 1800 et Gottfried Reinhold Treviranus dans son ouvrage Biologie oder Philosophie der lebenden Natur publie a Gottingen en 1804 en francais par le naturaliste francais Jean Baptiste de Lamarck dans ses Recherches sur l organisation des corps vivants en 1802 Tout ce qui est generalement commun aux vegetaux et aux animaux comme toutes les facultes qui sont propres a chacun de ces etres sans exception doit constituer l unique et vaste objet d une science particuliere qui n est pas encore fondee qui n a meme pas de nom et a laquelle je donnerai le nom de biologie Chez Lamarck on trouve pour la premiere fois une conception de l etre vivant qui reconnait son originalite comparativement aux objets inanimes sans pour autant la faire deroger aux lois de la physique contrairement a ce qu avaient tendance a faire les vitalistes et les fixistes Le meme Lamarck bien avant de donner des cours de biologie en 1819 separe dans son ouvrage Hydrogeologie paru egalement en 1802 la physique terrestre en trois parties la meteorologie etude de l atmosphere l hydrogeologie etude de la croute minerale la biologie etude des corps vivants Les savants allemands a l appel de Treviranus lancent les meticuleux inventaires de la flore et de la faune realises par ceux qui respectivement se nommeront botanistes et zoologistes Vers le milieu du XIX e siecle un interet pour les fonctions du vivant oriente la recherche biologique vers la physiologie HistoireArticles detailles Histoire de la biologie et Chronologie de la biologie Principes fondateursDefinition de l objet Definir la vie L objet de la biologie est l etre vivant et la vie dans son ensemble et son fonctionnement Mais qu est ce qu un etre vivant En quoi se differencie t il des objets inanimes et des machines Et qu est ce que la vie A ces questions les biologistes n ont actuellement pas de reponse precise qui fasse l unanimite dans la communaute scientifique Certains d entre eux pensent meme que ces questions sont sans objet Ainsi en 1878 Claude Bernard dans la premiere des Lecons sur les phenomenes de la vie communs aux animaux et aux vegetaux declare explicitement on peut caracteriser la vie mais non la definir car la biologie doit etre une science experimentale ce serait la une definition a priori et la methode qui consiste a definir et a tout deduire d une definition peut convenir aux sciences de l esprit mais elle est contraire a l esprit meme des sciences experimentales En consequence il suffit que l on s entende sur le mot vie pour l employer et il est illusoire et chimerique contraire a l esprit meme de la science d en chercher une definition absolue La biologie semble etre restee fidele a cette conception puisqu elle continue a ne pas precisement definir la notion de vie pour se limiter a l analyse de choses naturelles ou parfois en partie creees par l humain via la selection puis le genie genetique que le sens commun lui designe comme vivants Cette analyse permet de mettre en evidence un certain nombre de caracteres communs a ces objets d etude et ainsi d appliquer ce qualificatif de vivant a d autres objets presentant les memes caracteres Cette methode exclusivement analytique et experimentale a considerablement renforce l efficacite et la scientificite du travail du biologiste comparativement aux conceptions souvent speculatives d avant Claude Bernard Elle a cependant amene une physicalisation telle que l on a parfois l impression que pour rendre scientifique la biologie il a fallu nier toute specificite a son objet De fait certains biologistes en viennent a declarer que la vie n existe pas ou plus exactement qu elle serait un processus physico chimique parmi d autres Le premier d entre eux est probablement Albert Szent Gyorgyi prix Nobel de medecine en 1937 qui a declare La vie en tant que telle n existe pas personne ne l a jamais vue Le plus connu est Francois Jacob On n interroge plus la vie aujourd hui dans les laboratoires On ne cherche plus a en cerner les contours C est aux algorithmes du monde vivant que s interesse aujourd hui la biologie Plus recemment c est aussi la position d Henri Atlan L objet de la biologie est physico chimique A partir du moment ou l on fait de la biochimie et de la biophysique et ou l on comprend les mecanismes physico chimiques qui rendent compte des proprietes des etres vivants alors la vie s evanouit Aujourd hui un biologiste moleculaire n a pas a utiliser pour son travail le mot vie Cela s explique historiquement il s occupe d une chimie qui existe dans la nature dans un certain nombre de systemes physico chimiques particuliers aux proprietes specifiques et appeles animaux ou plantes c est tout Cette derniere citation illustre la confusion entre l etude de la vie et celle de la matiere des etres vivants ou transparait la tentation de reduire la biologie a la seule biologie moleculaire en niant au vivant grace au nivellement que permet la chimie toute specificite qui ne soit pas une simple difference physico chimique Autrement dit il est tentant en reduisant la biologie a la biologie moleculaire de ne differencier le vivant de l inanime que par les criteres par lesquels la biologie moleculaire se differencie du reste de la chimie Vivant et inanime Andre Pichot affirme que Cette negation de la specificite du vivant pourrait venir d une conception ou l on n admet aucune discontinuite entre vivant et inanime pour conserver un univers coherent et unifie On peut y admettre une gradation progressive entre l inanime et le vivant tant dans les formes actuelles les virus censes etre a la limite du vivant et de l inanime que dans l apparition de la vie sur Terre cette apparition y est comprise comme une phase prebiotique progressive sans discontinuite marquee Cette negation de la specificite du vivant qui se veut materialiste semble confondre simplement le materialisme epistemologique l etude critique des sciences et les sciences de la matiere proprement dites En biologie tenter d expliquer la notion de vie et la specificite de l etre vivant peut conduire aux notions de vitalisme ou meme d animisme car en s ecartant un peu de la physico chimie on peut sortir du materialisme epistemologique Si bien qu aujourd hui on a l impression que ce que vise la biologie n est pas tant l etude de la vie ou de l etre vivant dans ce qu il a de specifique relativement a l objet inanime que sa pure et simple negation le nivellement et l unification de l univers par la physico chimie Comme si pour unifier il valait mieux nier les solutions de continuite que les comprendre Une autre approche plus systemique est ainsi resumee en 1970 par Francois Jacob Tout objet que considere la Biologie represente un systeme de systemes lui meme element d un systeme d ordre superieur il obeit parfois a des regles qui ne peuvent etre deduites de sa propre analyse c est une des bases de l ecologie scientifique et de son approche ecosystemique Le probleme de la specificite de l etre vivant n est donc pas encore regle par la biologie moderne qui ainsi n a donc aucune definition claire et explicite de son objet Ce probleme est seulement occulte de diverses manieres qui toutes tendent a ramener faute de mieux la conception de Descartes de l etre vivant comme plus ou moins semblable a une machine tres complexe Rares sont les biologistes qui s inscrivent en faux contre cette approximation en avancant une conception du vivant plus precise visant a se rapprocher de la realite Un certain nombre de travaux en biologie theorique tentent en effet de depasser les limitations auxquelles on s est heurtees jusqu a present tels que ceux de Francisco Varela Robert Rosen ou Stuart Kauffman L enjeu est alors souvent de tenter d apprehender les differences entre biologie et physique Evolution Article detaille Evolution Charles Darwin en 1868 Page titre du Origin of Species L Origine des especes de Charles Darwin La premiere theorie de l evolution du vivant a ete avancee par Jean Baptiste Lamarck dans son ouvrage Philosophie Zoologique en 1809 Comme son titre l indique elle se presente sous la forme d un systeme philosophique bien qu elle pose les bases essentielles pour la comprehension des etres vivants et de leur evolution Cinquante ans plus tard en 1859 avec la parution de L Origine des especes Charles Darwin propose une explication scientifique de l evolution sous la forme d un mecanisme simple avec le principe de selection naturelle Avec le temps la theorie originelle de Darwin a ete affinee avec les resultats des experiences et observations que les biologistes ont effectuees La theorie faisant actuellement consensus est celle de la theorie synthetique de l evolution appelee aussi neodarwinisme Le caractere evolutionniste de la vie a pendant tres longtemps ete discute et est meme encore mis en doute par certaines personnes en dehors de la communaute scientifique mais aucune de ces objections a la theorie de l evolution n est scientifiquement fondee La communaute scientifique a depuis tres largement admis l evolutionnisme de la vie comme un fait demontre par l experience et l observation a maintes reprises notamment par l examen des fossiles en paleontologie qui montre l evolution des formes de vie a travers le temps l anatomie comparee qui met en evidence les similitudes morphologiques entre des animaux pourtant differents l heredite qui explique les variations genetiques d une generation a une autre l etude comparee du genome de plusieurs organismes qui montre l eloignement plus ou moins important dans l arbre phylogenetique permettant ainsi de retracer l evolution et l eloignement des differentes formes de vie la culture selective des plantes et la domestication des animaux sont la mise en application par les humains du principe de selection naturelle Diversite Article detaille Biodiversite Si la biologie est si vaste c est en raison de l extreme diversite du vivant qui se presente sous tellement de formes que l on peut avoir du mal a discerner des points communs Une hierarchisation du vivant a tout de meme ete realisee qui est le domaine de la systematique et de la taxinomie Tous les etres vivants sont classes en trois domaines les bacteries les archees les eucaryotes Universalite Structure en 3D de la molecule d ADN Bien qu etant differentes toutes les formes de vie partagent des caracteres communs Ce qui porte a croire que la vie sur Terre a pour origine une seule et meme forme de vie designee sous l acronyme de LUCA pour l anglais Last universal common ancestor qui serait apparue sur Terre il y a au moins 2 5 milliards d annees Les principaux caracteres universels du vivant sont le carbone qui par ses caracteristiques physiques sert de squelette a tous les composes organiques l ADN et l ARN qui servent de support au genome et assurent la transmission de ce dernier a la descendance lors de la reproduction la cellule qui est la plus petite unite vivante Ce dernier point est discute au sein de la communaute scientifique car les virus sont consideres comme vivants par certains biologistes alors qu ils ne sont pas faits de cellules Domaines d etudesEn raison du caractere extremement vaste du sujet l etude de la biologie necessite un morcellement en domaines d etudes Une approche un peu reductrice mais ayant l avantage de clarifier les themes consiste a definir des niveaux d organisation Dans un souci de parvenir a une comprehension plus globale de la biologie des ponts se sont naturellement crees entre les differentes disciplines Permet l exploration de differents sujets originaux comme la biologie moleculaire la biotechnologie la toxicologie la science biomedicale etc Structure du vivant Articles detailles Biologie moleculaire et Biologie cellulaire Structure d une cellule vegetale Les domaines etudiant la structure du vivant sont a l echelle de l atome pour la biologie moleculaire et de la cellule pour la biologie cellulaire Le domaine de la biologie moleculaire etudie les composes de bases du vivant comme l ADN et les proteines Pendant longtemps on a cru que les lois de la chimie regissant le vivant etaient differentes de celles pour la matiere inanimee Mais depuis la synthese de nombreux composes organiques il est clairement admis que les lois chimiques sont les memes que pour la matiere inorganique Aucune force vitale n insuffle la vie a la matiere comme on le pensait avant avec la theorie vitaliste La mise au point du microscope avec lequel Robert Hooke a decouvert les cellules en 1665 a marque la naissance de la biologie cellulaire et celle d un monde alors insoupconne Cette decouverte et les nombreuses qui ont suivi ont permis d expliquer certains phenomenes comme ce que l on qualifiait a l epoque de generation spontanee C est a cette echelle que l on rencontre les premiers organismes vivants Anatomie et physiologie Aspect de differents squelettes d apres le Larousse de 1922 Articles detailles Histologie Physiologie et Anatomie Prise au sens structurelle et fonctionnelle la biologie recouvre egalement l ensemble des disciplines classiques et modernes qui etudient des structures comme les tissus avec l histologie ou les organes avec l anatomie La physiologie quant a elle etudie les principes mecaniques physiques et biochimiques des organismes vivants et est separee en deux branches la physiologie vegetale et la physiologie animale Diversite et evolution L arbre phylogenetique Articles detailles Taxinomie Systematique Biologie de l evolution Botanique et Zoologie L extreme diversite du vivant n empeche en rien le groupement en entites ou taxons Taxinomie leurs relations les uns par rapport aux autres et leur classement systematique Interactions Articles detailles Ecologie et Ethologie Les interactions des etres vivants entre eux et les liens les unissant avec leur environnement est le domaine de l ecologie L ethologie quant a elle etudie le comportement animal dans le milieu naturel Niveaux d observation et disciplines Les Sciences de la Vie comprennent de nombreuses disciplines et sous disciplines plus ou moins reliees entre elles et parfois imbriquees Ces disciplines sont organisees soit par niveau d observation soit par approche methodologique soit par type d organisme etudie Niveau d observation Exemple Disciplines moleculaire molecules biologiques proteines ADN ARN chimie organique biochimie biologie moleculaire microscopique composants de la cellule organites biologie cellulaire cytologie cellules organismes unicellulaires microbiologie tissus histologie organes physiologie macroscopique organismes individus biologie des organismes anatomie ethologie populationnel colonies populations metapopulations biologie des populations genetique des populations specifique espece taxinomie phylogeographie etc supra specifique groupes d especes ecosystemes evolution humaine systematique ecologie phylogenieApplicationsUn laboratoire a l institut de biochimie de Cologne Les applications des decouvertes en biologie sont nombreuses et tres presentes dans le quotidien de l etre humain Les avancees importantes de ces dernieres decennies en medecine ont principalement pour origine les decouvertes sur le fonctionnement du corps humain Le domaine pharmaceutique profite egalement des avancees en chimie organique Plus recemment la decouverte de la structure de l ADN et une meilleure comprehension de l heredite ont permis de modifier finement les etres vivants par notamment les techniques de genie genetique et trouvent des applications dans les domaines agricole et agro alimentaire La biologie peut egalement avoir des applications en criminologie Dans la Revue francaise de criminologie et de droit penal Laurent Lemasson presente trois correlations entre biologie et criminalite mises en evidence par differents chercheurs la presence des genes MAOA et HTR2B chez une part importante de criminels un fonctionnement anormal des regions frontales et temporales du cerveau enfin un etat de sous excitation physiologique chez les criminels multirecidivistes Impacts sur la societeDepuis le developpement de la biologie moleculaire et de la physiologie cellulaire dans la seconde partie du XX e siecle les progres de la biologie sont devenus quotidiens et ont un impact enorme sur la societe comprehension des mecanismes moleculaires de plusieurs centaines de maladies amelioration des traitements contre le cancer comprehension des mecanismes neurologiques amelioration des traitements des maladies mentales et depistage de tares genetiques in utero Une meilleure comprehension de l evolution moleculaire substrat physique a l evolution des especes permet de transposer aux humains les decouvertes faites sur les animaux y compris des vers comme C elegans ou la mouche drosophile dont on a montre que les mecanismes moleculaires de segmentation du corps au cours de l embryogenese sont identiques a ceux de l humain et de maniere generale a tout le vivant metazoaire Toutefois les progres tres rapides de la biologie suscitent parfois des interrogations philosophiques de vives inquietudes voire une forte opposition de certaines associations ou organisations non gouvernementales ONG On peut citer notamment le clonage les organismes genetiquement modifies OGM le sequencage et les problemes de propriete intellectuelle qui en decoulent Animalia Bos primigenius taurus Planta Triticum Fungi Morchella esculenta Stramenopila Chromista Fucus serratus Bacteria Gemmatimonas aurantiaca 1 Micrometer Archaea Halobacteria Virus Gamma phage Notes et referencesPeter H Raven Kenneth A Mason Georges B Johnson Jonathan B Losos Susan R Singer Biologie De Boeck Superieur 2017 lire en ligne p 2 Logos et Biologie Etymologie et historique Portail lexical du CNRTL en ligne Prs Geerinck et Balleux Repertoire des racines d origine hellenique utilisees dans la terminologie 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Medelhavsomraodets faoglar i falt Albert Bonniers Forlag Stockholm 1999 par Jean Louis Parmentier avec adaptation et supervision scientifique de Guilhem Lesaffre ISBN 978 2 603 01142 3 Louis Chaix Patrice Meniel Archeozoologie les animaux et l archeologie coll des Hesperides editions Errance Paris 2001 240 p ISBN 978 2 87772 218 6 Jared Diamond Le troisieme chimpanze essai sur l evolution et l avenir de l animal humain Gallimard Paris 2000 Traduction de The Third Chimpanzee Harper Collins New York 1992 Andre Langaney Les Hommes passe present conditionnel Armand Colin Paris 1998 252 p ISBN 978 2 200 37117 3 Ecologie et milieux Jean Louis Morere dir Les etres vivants dans leur milieu sciences naturelles 2de Hachette Paris 1985 240 p ISBN 978 2 01 010680 4 Gunnar Thorson La vie dans la mer coll L Univers des connaissances Hachette Paris 1971 256 p Texte francais de Georges H Gallet Bernard Boullard Guerre et paix dans le regne vegetal Ellipses Aubin Imprimeur Paris 1990 336 p ISBN 978 2 7298 9033 9 Claude Leroy La foret redecouverte Belin Paris aout 2009 732 p ISBN 978 2 7011 4886 1 Biogeographie et culture botanique Paul Ozenda Vegetation du continent europeen Delachaux et Niestle Lausanne Paris 1994 272 p ISBN 978 2 603 00954 3 Francois Couplan Ce sont les plantes qui sauvent ma botanique gourmande recit Plon Paris 2005 462 p ISBN 978 2 259 19670 3 Gerard Debuigne Francois Couplan Petit Larousse des plantes qui guerissent 500 plantes edition Larousse 2006 896 p ISBN 978 2 03 582256 7 Christian et Elisabeth Busser Les plantes des Vosges medecine et traditions populaires avec un guide de decouverte et d emploi de 200 plantes medicinales La Nuee bleue DNA Strasbourg 2005 348 p Preface de Jean Marie Pelt ISBN 978 2 7165 0657 1 Initiation a la biophysique et biologie humaine Andre Aurengo Bertran Auvert Francois Leterrier Thierry Petitclerc sous la direction de Francois Gremy Biophysique coll PCEM editee par Francois Gremy en 1982 2e tirage corrige Medecine Sciences Flammarion Paris 1994 494 p ISBN 978 2 257 10594 3 Alain Blacque Belair Bernard Mathieu de Fossey et Max Fourestier Dictionnaire des constantes biologiques et physiques en medecine applications cliniques pratiques 6e ed editions Maloine Paris 1991 848 p ISBN 978 2 224 01907 5 P Boulanger J Polonovski G Biserte et M Dautrevaux Abrege de biochimie medicale Masson Paris 1re ed 1981 2e ed 1989 1 Les constituants des organismes vivants 2e ed 1989 348 p ISBN 978 2 225 81640 6 2 Metabolismes et regulations 1re ed 1981 344 p ISBN 978 2 225 68740 2 G Crouzols M Lechaud avec la mise a jour de F Lasnier Hygiene et biologie humaines editions Jacques Lanore Malakoff 1993 288 p ISBN 978 2 86268 035 4 Christian Robert et Pierre Vincent Biologie amp physiologie humaines Vuibert Paris 1995 678 p ISBN 978 2 7117 5234 8 Pierre Jacquemin Jean Louis Jacquemin illustrations Abrege de parasitologie clinique Collection d abreges de medecine sous la direction du Pr Le Guyon Masson et Cie editeurs Paris 1974 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et jeunesse de L Origine Paris Champion Classiques 2009 Traduction de On the origin of species by means of natural selection or the preservation of favoured races in the struggle of life publie en 1859 Texte de Daniel Becquemond a partir de la traduction de l anglais d Edmond Barbier Introduction de Jean Marc Drouin ISBN 978 2 08 070685 0 Paul Mazliak Les fondements de la biologie le XIX e siecle de Darwin Pasteur et Claude Bernard Vuibert Adapt 2002 346 p ISBN 978 2 7117 5352 9 La biologie source de debats contemporains Edward O Wilson L unicite du savoir de la biologie a l art une meme connaissance Robert Laffont Paris 2000 398 p ISBN 978 2 221 08877 7 Traduction de Consilience Alfred A Knopf New York 1998 ISBN 978 0 679 45077 1 Bernard Dussart Henri Friedel Roger Dajoz Roger Molinier Jacques Daget Jean Keiling Francois Ramade Rene Oizon Claude Marie Vadrot Francois Lapoix Michel et Claire Corajoud Dominique Simonnet Jean Pierre Charbonneau Encyclopedie de l ecologie le present en question Librairie Larousse 1977 488 p Presentation de Henri Friedel Conclusion de Rene Dumont Un livre vert a plusieurs voix contemporain de l essor du courant politique vert ISBN 978 2 03 070102 7 Articles connexes Une categorie est consacree a ce sujet Biologie Histoire de la biologie Biologistes celebres Biologie numerique Biosystemique Naissance du vivant Vie sur d autres planetes Liens externes Ressource relative a la litterature The Encyclopedia of Science Fiction Ressource relative a la sante Medical Subject Headings Ressource relative a l audiovisuel France 24 Ressource relative a la recherche JSTOR Notices dans des dictionnaires ou encyclopedies generalistes Britannica Brockhaus Den Store Danske Encyklopaedi Dictionnaire historique de la Suisse Encyclopedie de l Ukraine moderne Gran Enciclopedia Aragonesa Gran Enciclopedia Catalana Internetowa encyklopedia PWN Larousse Store norske leksikon Treccani Universalis Notices d autorite BnF donnees LCCN GND Japon Espagne Israel 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