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Phylum

En systématique, le phylum (au pluriel phyla) est le deuxième niveau dans la classification classique des espèces vivantes, le premier étant le règne. Ce terme est accepté par toutes les disciplines concernées par le monde vivant, comme terme principal ou comme terme de remplacement autorisé. Les mots embranchement et division (ou divisio) sont synonymes mais ne sont utilisés que pour certains règnes, embranchement en zoologie et division ou divisio en botanique.

Selon les biologistes Ruggiero et al. (2015), il existe sept règnes du vivant, constitués de 96 phylums.
Historique et définitions
Le terme phylum a été inventé en 1866 par Ernst Haeckel à partir du grec phylon (φῦλον, « race »), apparenté à phyle (φυλή, « tribu, clan »),. Haeckel a observé que les espèces évoluaient constamment vers de nouvelles espèces qui semblaient conserver peu de caractéristiques cohérentes entre elles et donc peu de caractéristiques qui les distinguaient en tant que groupe distinct (« une unité autonome ») :
« Wohl aber ist eine solche reale und vollkommen abgeschlossene Einheit die Summe aller Species, welche aus einer und derselben gemeinschaftlichen Stammform allmählig sich entwickelt haben, wie z. B. alle Wirbelthiere. Diese Summe nennen wir Stamm (Phylon) »
qui peut se traduire par :
« Cependant, une unité réelle et complètement autonome est peut-être l'agrégat de toutes les espèces qui ont progressivement évolué à partir de la même forme originelle commune, comme, par exemple [sic], tous les vertébrés. Nous appelons cet agrégat [un] Stamm [c'est-à-dire une race] (Phylon). »
En taxinomie végétale, August Wilhelm Eichler (1883) a classé les plantes en cinq groupes appelés divisions, un terme encore utilisé pour désigner des groupes de plantes, d'algues et de champignons. Les définitions des embranchements zoologiques ont changé depuis les six classes de Carl von Linné et les quatre embranchements de Georges Cuvier.
De manière informelle, les embranchements peuvent être considérés comme des groupements d'organismes basés sur une spécialisation générale du plan d'organisation. Dans sa forme la plus élémentaire, un phylum peut être défini de deux manières : comme un groupe d'organismes présentant un certain degré de similitude morphologique ou développementale (définition phénétique), ou comme un groupe d'organismes présentant un certain degré de parenté évolutive (définition phylogénétique). Il n'est pas satisfaisant de tenter de définir un niveau de la hiérarchie linnéenne sans référence à la parenté (évolutive), mais une définition phénétique est utile pour aborder des questions de nature morphologique, telles que le degré de réussite des différents plans corporels.
Définition basée sur la parenté génétique
La mesure objective la plus importante dans les définitions ci-dessus est le « certain degré » qui définit comment différents organismes doivent être membres de différents embranchements. L'exigence minimale est que tous les organismes d'un embranchement soient clairement plus étroitement apparentés les uns aux autres qu'à tout autre groupe.10 Même cette exigence est problématique, car elle dépend de la connaissance des relations entre les organismes : à mesure que nous disposons de plus de données, notamment grâce aux études moléculaires, nous sommes en mesure de mieux déterminer les relations entre les groupes. Ainsi, les embranchements peuvent fusionner ou se diviser s'il apparaît clairement qu'ils sont apparentés ou non. Par exemple, les Pogonophores (« vers barbus ») ont été décrits comme un nouveau phylum (les Pogonophora) au milieu du 20e siècle, mais des travaux moléculaires réalisés près d'un demi-siècle plus tard ont révélé qu'il s'agissait d'un groupe d'annélides, ce qui a entraîné la fusion des phylums (les vers barbus constituent désormais une famille d'annélides). D'autre part, l'embranchement hautement parasitaire des Mesozoa s'est scindé en deux embranchements ( et Rhombozoa) lorsqu'on a découvert que les Orthonectidae étaient probablement des deutérostomiens et les Rhombozoa des protostomiens.
Cette mutabilité des embranchements a conduit certains biologistes à demander l'abandon du concept de phylum au profit d'un classement des taxons en clades sans classification formelle en rangs taxinomiques.
Définition basée sur le plan d'organisation
Les paléontologues Graham Budd et ont proposé une définition de l'embranchement (ou phylum) basée sur le plan d'organisation (comme Haeckel l'avait fait un siècle plus tôt). Cette définition a été proposée parce que les organismes éteints sont les plus difficiles à classer : ils peuvent être des ramifications qui ont divergé de la ligne d'un phylum avant que tous les caractères définissant le phylum moderne n'aient été acquis. Selon la définition de Budd et Jensen, un phylum est défini par un ensemble de caractères partagés par tous ses représentants vivants.
Cette approche pose quelques problèmes mineurs : par exemple, certains membres d'un phylum peuvent avoir perdu des caractères ancestraux communs à la plupart de ses membres. De plus, cette définition est basée sur un point arbitraire dans le temps : le présent. Cependant, comme elle est basée sur des caractères, elle est facile à appliquer au registre fossile. Un problème majeur est qu'elle est basée sur une décision subjective concernant les groupes d'organismes qui devraient être considérés comme des phylums.
Cette approche est utile car elle facilite la classification des organismes éteints dans le « groupe parent » des phylums auxquels ils ressemblent le plus, en se basant uniquement sur des similitudes importantes sur le plan taxonomique. 10 Cependant, il est difficile de prouver qu'un fossile appartient au groupe de tête d'un phylum, car il doit présenter un caractère unique à un sous-ensemble du groupe de tête.10 En outre, les organismes du groupe de tête d'un phylum peuvent posséder le « plan d'organisation » du phylum sans avoir toutes les caractéristiques nécessaires pour en faire partie. Cela remet en cause l'idée que chaque phylum représente un plan d'organisation distinct.
Une classification fondée sur cette définition peut être fortement influencée par la survie fortuite de groupes rares, ce qui peut rendre un phylum beaucoup plus diversifié qu'il ne le serait autrement.
Suffixes des noms des phylums
Le nom des phylums se termine par le suffixe -phyta pour les plantes et les algues, par -mycota pour les champignons, par -ota pour les procaryotes (bactéries et archées) et par -viricota pour les virus. Pour le règne animal on ne trouve des suffixes standard qu'en dessous du rang de super-famille.
Liste des phylums par règne
Animaux (Animalia)
Selon le Catalogue of Life () :
Phylum | Espèces décrites |
Acanthocephala | 1 330 (vers parasites) |
Annelida | 17 515 (vers segmentés, sangsue, lombric…) |
Arthropoda | 1 165 847 (insectes, crustacés, arachnides, myriapodes) |
Brachiopoda | 435 (« coquillages » marins) |
Bryozoa | 20 584 (animaux marins produisant de la matière calcaire) |
Chaetognatha | 132 (vers marins, constituant du zooplancton) |
Chordata | 73 501 (vertébrés, amphioxus…) |
Cnidaria | 15 659 (coraux, anémone de mer, hydres…) |
Ctenophora | 216 (organismes marins ayant des cils locomoteurs) |
Cycliophora | 2 (organismes marins microscopiques) |
Dicyemida | 122 (parasites de céphalopodes) |
Echinodermata | 11 623 (oursins, étoiles de mer, concombres de mer…) |
Entoprocta | 171 (vers marins) |
Gastrotricha | 878 (vers marins) |
Gnathostomulida | 100 (vers marins) |
Hemichordata | 139 (vers marins) |
Kinorhyncha | 344 (invertébrés marins) |
Loricifera | 44 (organismes marins microscopiques) |
Micrognathozoa | 1 (Limnognathia maerski) |
Mollusca | 130 560 (bivalves, escargots, pieuvres, limaces…) |
Nematoda | 17 461 (vers ronds non segmentés : filaire de Bancroft, oxyure, ascaris…) |
Nematomorpha | 356 (vers non-segmentés cylindriques parasites d'arthropodes) |
Nemertea | 1 373 (vers possédant une trompe, presque tous marins) |
Onychophora | 230 (vers à pattes) |
Orthonectida | 26 (organismes marins) |
Phoronida | 19 (espèces marines) |
Placozoa | 4 (métazoaires aplatis en forme de plaque) |
Plathelminthes | 22 884 (vers plats : ver solitaire, douve du foie, planaire…) |
Porifera | 9 622 (éponges) |
Priapulida | 22 (vers marins possédant une trompe épineuse extensible) |
Rotifera | 2 014 (organismes aquatiques munis de cils vibratiles) |
Sipuncula | 205 (vers marins) |
Tardigrada | 1 461 (tardigrades) |
Xenacoelomorpha | 459 (vers marins) |
TOTAL: 34 | 1 495 339 |
Selon l'Interim Register of Marine and Nonmarine Genera (IRMNG) () :
- Acanthocephala
- †
- Annelida
- Arthropoda
- Brachiopoda
- Bryozoa
- Cephalorhyncha
- Chaetognatha
- Chitinozoa †
- Chordata
- Cnidaria
- Ctenophora
- Cycliophora
- Cycloneuralia
- Echinodermata
- Entoprocta
- Gastrotricha
- Gnathostomulida
- Hemichordata
- Hyolitha †
- Kinorhyncha
- Lobopoda †
- Loricifera
- Micrognathozoa
- Mollusca
- Nematoda
- Nematomorpha
- Nemertea
- Onychophora
- Orthonectida
- Phoronida
- Placozoa
- Platyhelminthes
- Porifera
- Priapulida
- Rhombozoa
- Rotifera
- Scalidophora
- Sipuncula
- Tardigrada
- Vendobionta †
- Vetulicolia †
- †
- Xenacoelomorpha
Plantes (Plantae)
Selon le Catalogue of Life (1er août 2023), Plantae est défini au sens large (Archaeplastida), comprenant les plantes terrestres (bryophytes et plantes vasculaires), les algues vertes et les algues rouges :
(bryophytes)
- Anthocerotophyta Stotler & Crand.-Stotl.
- Bryophyta Schimp.
- †Langiophytophyta Doweld
- Marchantiophyta Stotler & Crand.-Stotl.
(algues vertes)
- Charophyta Migula, 1897
- Chlorophyta
- Glaucophyta Skuja, 1954
(algues rouges)
- Rhodophyta
(plantes vasculaires)
- Tracheophyta
Selon la World Flora Online (), Plantae est défini au sens strict des plantes terrestres, comprenant les bryophytes et les plantes vasculaires :
sous-règne des Bryobiotina Trevis. - bryophytes
- Anthocerotophyta Stotler & Crand.-Stotl. - anthocérotes
- Bryophyta Schimp. - mousses
- Marchantiophyta Stotler & Crand.-Stotl. - hépatiques
sous-règne des Pteridobiotina Britton & Brown - plantes vasculaires
- Magnoliophyta Cronquist, Takht. & W.Zimm. ex Reveal - plantes à fleurs
- Cycadophyta Bessey - cycas
- Ginkgophyta Bessey - ginkgos
- Lycopodiophyta D.H.Scott - lycophytes
- Pinophyta Cronquist, Takht. & W.Zimm. ex Reveal - conifères
- Polypodiophyta Reveal - fougères et autres
Selon l'IRMNG () :
- Acritarcha †
- Anthocerotophyta
- Bryophyta
- †
- Charophyta
- Chlorophyta
- Glaucophyta
- †
- Marchantiophyta
- Rhodophyta
- Tracheophyta
Champignons (Fungi)
Selon le Catalogue of Life () :
- Ascomycota
- Basidiomycota
- Blastocladiomycota
- Chytridiomycota
- Entomophthoromycota
- Glomeromycota
- Mucoromycota
- Neocallimastigomycota
- Zoopagomycota
- Zygomycota
Selon l'IRMNG () :
- Aphelidiomycota
- Ascomycota
- Basidiomycota
- Blastocladiomycota
- Chytridiomycota
- Entomophthoromycota
- Glomeromycota
- †
- Rozellomycota
- Zygomycota
Protozoaires (Protozoa)
Selon le Catalogue of Life () :
- Amoebozoa
- G.J.M. Versteegh, T. Servais, M. Streng, A. Munnecke & D. Vachard, 2009
- Choanozoa
- Euglenozoa Cavalier-Smith, 1981
- Loukozoa Cavalier-Smith, 1999
- Metamonada Grassé, 1952 emend. Cavalier-Smith, 2003
- Microsporidia
- Mycetozoa
- Sarcomastigophora
- Sulcozoa Cavalier-Smith, 2013
Selon l'IRMNG () :
sous-règne Eozoa
- Loukozoa
- Metamonada
- Percolozoa
- Euglenozoa
sous-règne Sarcomastigota
- Amoebozoa
- Choanozoa
- Sulcozoa
Chromistes (Chromista)
Selon le Catalogue of Life () :
- Tikhonenkov, Janouškovec, Mylnikov, Mikhailov, Simdyanov, Aleoshin & Keeling, 2014
- Bigyra
- Cercozoa
- Ciliophora (ciliés)
- Cryptista Cavalier-Smith, 1989
- Foraminifera d'Orbigny, 1826 (foraminifères)
- Haptophyta D.J. Hibberd ex B. Edvardsen & W. Eikrem in Edvardsen et al., 2000
- Heliozoa
- Miozoa
- Ochrophyta (algues brunes, diatomées...)
- Oomycota (oomycètes)
- Seenivasan, Sausen, Medlin & Melkonian, 2013
- Radiozoa
Selon l'IRMNG () :
sous-règne Hacrobia
- Cryptista
- Haptophyta
- Heliozoa
sous-rène Harosa
- infra-règne Halvaria
- super-embranchement Alveolata
- Ciliophora
- Miozoa
- super-embranchement Heterokonta
- Bacillariophyta
- Bigyra
- Ochrophyta
- Pseudofungi
- Bigyromonada
- super-embranchement Alveolata
- infra-règne Rhizaria
- Cercozoa
- Retaria
Bactéries (Bacteria)
Selon la LPSN (12 avril 2025) le domaine des Bacteria comprend les phyla suivants, publiés de manière valide :
- Abditibacteriota Tahon et al. 2023
- Acidobacteriota Thrash & Coates 2021
- Actinomycetota Goodfellow 2021
- Aquificota Reysenbach 2021
- Armatimonadota Tamaki et al. 2021
- Atribacterota Katayama et al. 2021
- Bacillota Gibbons & Murray 2021
- Bacteroidota Krieg et al. 2021
- Balneolota Hahnke et al. 2021
- Caldisericota Mori et al. 2021
- Calditrichota Kublanov et al. 2021
- Chlamydiota Garrity & Holt 2021
- Chlorobiota Iino et al. 2021
- Chloroflexota Garrity & Holt 2021
- Chrysiogenota Garrity & Holt 2021
- Coprothermobacterota Pavan et al. 2021
- Cyanobacteriota Oren et al. 2022
- Deferribacterota Garrity & Holt 2021
- Deinococcota Weisburg et al. 2021
- Dictyoglomerota corrig. Patel 2021
- Elusimicrobiota Geissinger et al. 2021
- Fibrobacterota Garrity & Holt 2021
- Fidelibacterota Katayama et al. 2024
- Fusobacteriota Garrity & Holt 2021
- Gemmatimonadota Zhang et al. 2021
- Kiritimatiellota Spring et al. 2021
- Lentisphaerota Cho et al. 2021
- Minisyncoccota Nakajima et al. 2025
- Mycoplasmatota Murray 2021
- Nitrospinota Lücker et al. 2021
- Nitrospirota Garrity & Holt 2021
- Planctomycetota Garrity & Holt 2021
- Pseudomonadota Garrity et al. 2021
- Rhodothermota Munoz et al. 2021
- Spirochaetota Garrity & Holt 2021
- Synergistota Jumas-Bilak et al. 2021
- Thermodesulfobacteriota Garrity & Holt 2021
- Thermomicrobiota Garrity & Holt 2021
- Thermotogota Reysenbach 2021
- Verrucomicrobiota Hedlund 2021
- Vulcanimicrobiota Yabe et al. 2024
Selon la LPSN (12 avril 2025), le domaine des Bacteria inclut en outre les phyla candidats suivants (Ca. signifie Candidatus et les guillemets indiquent l'absence de statut nomenclatural) :
- « Ca. Acetithermota » corrig. Rinke et al. 2013
- « Ca. Aerophobota » corrig. Rinke et al. 2013
- « Ca. Altimarinota » corrig. Rinke et al. 2013
- « Ca. Aminicenantota » corrig. Rinke et al. 2013
- « Ca. Auribacterota » Williams et al. 2022
- « » corrig. Yeoh et al. 2016
- « » Chuvochina et al. 2019
- « » Hao et al. 2018
- « » Hahn et al. 2020
- « » corrig. Colman et al. 2016
- « » Rinke et al. 2013
- « » corrig. Rinke et al. 2013
- « » Zhang et al. 2022
- « » corrig. Rinke et al. 2013
- « » Rinke et al. 2013
- « » Martinez et al. 2019
- « » Begmatov et al. 2022
- « » Yeoh et al. 2016
- « » corrig. Ji et al. 2017
- « » Williams et al. 2022
- « » corrig. Rodriguez et al. 2020
- « » corrig. Kirkegaard et al. 2016
- « » corrig. Rinke et al. 2013
- « » corrig. Hernsdorf et al. 2017
- « » Zhang et al. 2022
- « » Williams et al. 2022
- « » corrig. Rinke et al. 2013
- « » corrig. Jungbluth et al. 2017
- « » corrig. Kantor et al. 2015
- « » Youssef et al. 2019
- « » corrig. Eloe-Fadrosh et al. 2016
- « » corrig. Rinke et al. 2013
- « » Williams et al. 2022
- « » Nobu et al. 2023
- « » corrig. Yadav et al. 2020
- « » corrig. Anantharaman et al. 2016
- « » Viljakainen & Hug 2021
- « » corrig. Rinke et al. 2013
- « » corrig. Sekiguchi et al. 2015
- « » corrig. Barnum et al. 2018
- « » corrig. Rinke et al. 2013
- « » Rinke et al. 2013
- « » corrig. Castelle et al. 2017
- « » corrig. Wrighton et al. 2012
- « » Zhang et al. 2022
- « » corrig. Anantharaman et al. 2016
- « » corrig. Albertsen et al. 2013
- « » Kadnikov et al. 2019
- « » corrig. Cui et al. 2021
- « » corrig. Hug et al. 2016
Archées (Archaea)
Selon la LPSN () :
- corrig. Rinke et al. 2013
- Aigarchaeota Nunoura et al. 2011
- Asgardarchaeota Da Cunha et al. 2017
- corrig. Nunoura et al. 2011
- Liu et al. 2021
- Liu et al. 2021
- Rinke et al. 2013
- Euryarchaeota Garrity & Holt 2001
- Xie et al. 2022
- Chuvochina et al. 2019
- McGonigle et al. 2019
- Liu et al. 2021
- Liu et al. 2021
- Probst et al. 2018
- corrig. Probst et al. 2018
- Jungbluth et al. 2017
- corrig. Rinke et al. 2013
- Liu et al. 2021
- Korarchaeota Ludwig & Klenk 2001
- Spang et al. 2015
- Lokiarchaeota corrig. Spang et al. 2015
- corrig. Vanwonterghem et al. 2016
- Baker & Dick 2013
- Sakai et al. 2022
- Nanoarchaeota Huber et al. 2002
- Nanohaloarchaeota Rinke et al. 2013
- Wang et al. 2019
- Brochier-Armanet et al. 2021
- Xie et al. 2022
- Odinarchaeota Zaremba-Niedzwiedzka et al. 2017
- Rinke et al. 2013
- corrig. Rinke et al. 2019
- Farag et al. 2021
- Xie et al. 2022
- Thermoplasmatota Rinke et al. 2019
- Garrity & Holt 2021
- Dombrowski et al. 2020
- Vanwonterghem et al. 2016
- Liu et al. 2021
Virus
Selon l'International Committee on Taxonomy of Viruses () :
- domaine
- règne
- règne
- domaine Duplodnaviria
- règne Heunggongvirae
- règne Heunggongvirae
- domaine Monodnaviria
- règne
- règne
- règne
- règne Trapavirae
- Saleviricota
- règne
- domaine Riboviria
- règne Orthornavirae
- Kitrinoviricota
- Negarnaviricota
- Pisuviricota
- règne
- règne Orthornavirae
- domaine Ribozyviria
- domaine
- règne
- Nucleocytoviricota
- Preplasmiviricota
- règne Helvetiavirae
- Dividoviricota
- règne
Autres rangs taxonomiques
Les rangs taxonomiques utilisés en systématique linnéenne pour indiquer la hiérarchie entre les taxons nommés dans la classification du monde vivant sont les suivants (par ordre décroissant) :
- Super-règne, Empire, Domaine (Superregnum, Imperium, Dominium)
- Règne (Regnum)
- Sous-règne (Subregnum)
- Rameau (Ramus, « branch » en anglais)
- Infra-règne (Infraregnum)
- Super-embranchement, Super-division (Superphylum, Superdivisio)
- Embranchement, Division (Phylum, Divisio)
- Sous-embranchement, Sous-division (Subphylum, Subdivisio)
- Infra-embranchement (Infraphylum)
- Micro-embranchement (Microphylum)
- Super-classe (Superclassis)
- Classe (Classis)
- Sous-classe (Subclassis)
- Infra-classe (Infraclassis)
- Super-ordre (Superordo)
- Ordre (Ordo)
- Sous-ordre (Subordo)
- Infra-ordre (Infraordo)
- Micro-ordre (Microordo)
- Super-famille (Superfamilia)
- Famille (Familia)
- Sous-famille (Subfamilia)
- Super-tribu (Supertribus)
- Tribu (Tribus)
- Sous-tribu (Subtribus)
- Genre (Genus)
- Sous-genre (Subgenus)
- Section (Sectio)
- Sous-section (Subsectio)
- Espèce (Species)
- Sous-espèce (subspecies) – dernier rang zoologique officiel
- Variété (varietas) – race étant un rang zoologique informel
- Sous-variété (subvarietas) – sous-race étant un rang zoologique informel
- Forme (forma) dernier rang en mycologie – forme étant un rang zoologique informel
- Sous-forme (subforma)
Notes et références
Notes
- En gras les sept rangs principaux (RECOFGE, sigle mnémotechnique pour Règne/Embranchement/Classe/Ordre/Famille/Genre/Espèce), en maigre les rangs secondaires. En romain les noms vulgaires, en italique les noms scientifiques.
- Un embranchement en zoologie, ou division en botanique, est traditionnellement caractérisé par une description schématique appelée « plan d'organisation ».
- Les taxons aux rangs de race et de sous-race (animaux domestiques principalement) n'ont pas de nom scientifique. Ils ne sont pas régis par le Code international de nomenclature zoologique (CINZ).
Références
- (es) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en espagnol intitulé « Filo » (voir la liste des auteurs).
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Voir aussi
Articles connexes
- Classification scientifique des espèces
- Classification classique
- Végétal
- Animal
- Classification phylogénétique
- Cladistique
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Division biologie et Embranchement biologie redirigent ici Pour les autres significations voir Division homonymie et Embranchement Pour les articles homonymes voir Phylum homonymie En systematique le phylum au pluriel phyla est le deuxieme niveau dans la classification classique des especes vivantes le premier etant le regne Ce terme est accepte par toutes les disciplines concernees par le monde vivant comme terme principal ou comme terme de remplacement autorise Les mots embranchement et division ou divisio sont synonymes mais ne sont utilises que pour certains regnes embranchement en zoologie et division ou divisio en botanique Principaux rangs taxinomiques Le phylum est le niveau entre le regne et la classe Le phylum de ce schema est appele division concernant le regne vegetal et embranchement concernant le regne animal Selon les biologistes Ruggiero et al 2015 il existe sept regnes du vivant constitues de 96 phylums Historique et definitionsLe terme phylum a ete invente en 1866 par Ernst Haeckel a partir du grec phylon fῦlon race apparente a phyle fylh tribu clan Haeckel a observe que les especes evoluaient constamment vers de nouvelles especes qui semblaient conserver peu de caracteristiques coherentes entre elles et donc peu de caracteristiques qui les distinguaient en tant que groupe distinct une unite autonome Wohl aber ist eine solche reale und vollkommen abgeschlossene Einheit die Summe aller Species welche aus einer und derselben gemeinschaftlichen Stammform allmahlig sich entwickelt haben wie z B alle Wirbelthiere Diese Summe nennen wir Stamm Phylon qui peut se traduire par Cependant une unite reelle et completement autonome est peut etre l agregat de toutes les especes qui ont progressivement evolue a partir de la meme forme originelle commune comme par exemple sic tous les vertebres Nous appelons cet agregat un Stamm c est a dire une race Phylon En taxinomie vegetale August Wilhelm Eichler 1883 a classe les plantes en cinq groupes appeles divisions un terme encore utilise pour designer des groupes de plantes d algues et de champignons Les definitions des embranchements zoologiques ont change depuis les six classes de Carl von Linne et les quatre embranchements de Georges Cuvier De maniere informelle les embranchements peuvent etre consideres comme des groupements d organismes bases sur une specialisation generale du plan d organisation Dans sa forme la plus elementaire un phylum peut etre defini de deux manieres comme un groupe d organismes presentant un certain degre de similitude morphologique ou developpementale definition phenetique ou comme un groupe d organismes presentant un certain degre de parente evolutive definition phylogenetique Il n est pas satisfaisant de tenter de definir un niveau de la hierarchie linneenne sans reference a la parente evolutive mais une definition phenetique est utile pour aborder des questions de nature morphologique telles que le degre de reussite des differents plans corporels Definition basee sur la parente genetique La mesure objective la plus importante dans les definitions ci dessus est le certain degre qui definit comment differents organismes doivent etre membres de differents embranchements L exigence minimale est que tous les organismes d un embranchement soient clairement plus etroitement apparentes les uns aux autres qu a tout autre groupe 10 Meme cette exigence est problematique car elle depend de la connaissance des relations entre les organismes a mesure que nous disposons de plus de donnees notamment grace aux etudes moleculaires nous sommes en mesure de mieux determiner les relations entre les groupes Ainsi les embranchements peuvent fusionner ou se diviser s il apparait clairement qu ils sont apparentes ou non Par exemple les Pogonophores vers barbus ont ete decrits comme un nouveau phylum les Pogonophora au milieu du 20 e siecle mais des travaux moleculaires realises pres d un demi siecle plus tard ont revele qu il s agissait d un groupe d annelides ce qui a entraine la fusion des phylums les vers barbus constituent desormais une famille d annelides D autre part l embranchement hautement parasitaire des Mesozoa s est scinde en deux embranchements et Rhombozoa lorsqu on a decouvert que les Orthonectidae etaient probablement des deuterostomiens et les Rhombozoa des protostomiens Cette mutabilite des embranchements a conduit certains biologistes a demander l abandon du concept de phylum au profit d un classement des taxons en clades sans classification formelle en rangs taxinomiques Definition basee sur le plan d organisation Les paleontologues Graham Budd et ont propose une definition de l embranchement ou phylum basee sur le plan d organisation comme Haeckel l avait fait un siecle plus tot Cette definition a ete proposee parce que les organismes eteints sont les plus difficiles a classer ils peuvent etre des ramifications qui ont diverge de la ligne d un phylum avant que tous les caracteres definissant le phylum moderne n aient ete acquis Selon la definition de Budd et Jensen un phylum est defini par un ensemble de caracteres partages par tous ses representants vivants Cette approche pose quelques problemes mineurs par exemple certains membres d un phylum peuvent avoir perdu des caracteres ancestraux communs a la plupart de ses membres De plus cette definition est basee sur un point arbitraire dans le temps le present Cependant comme elle est basee sur des caracteres elle est facile a appliquer au registre fossile Un probleme majeur est qu elle est basee sur une decision subjective concernant les groupes d organismes qui devraient etre consideres comme des phylums Cette approche est utile car elle facilite la classification des organismes eteints dans le groupe parent des phylums auxquels ils ressemblent le plus en se basant uniquement sur des similitudes importantes sur le plan taxonomique 10 Cependant il est difficile de prouver qu un fossile appartient au groupe de tete d un phylum car il doit presenter un caractere unique a un sous ensemble du groupe de tete 10 En outre les organismes du groupe de tete d un phylum peuvent posseder le plan d organisation du phylum sans avoir toutes les caracteristiques necessaires pour en faire partie Cela remet en cause l idee que chaque phylum represente un plan d organisation distinct Une classification fondee sur cette definition peut etre fortement influencee par la survie fortuite de groupes rares ce qui peut rendre un phylum beaucoup plus diversifie qu il ne le serait autrement Suffixes des noms des phylumsLe nom des phylums se termine par le suffixe phyta pour les plantes et les algues par mycota pour les champignons par ota pour les procaryotes bacteries et archees et par viricota pour les virus Pour le regne animal on ne trouve des suffixes standard qu en dessous du rang de super famille Liste des phylums par regneAnimaux Animalia Une categorie est consacree a ce sujet Embranchement d animaux nom scientifique Selon le Catalogue of Life 1er aout 2023 Phylum Especes decrites Acanthocephala 1 330 vers parasites Annelida 17 515 vers segmentes sangsue lombric Arthropoda 1 165 847 insectes crustaces arachnides myriapodes Brachiopoda 435 coquillages marins Bryozoa 20 584 animaux marins produisant de la matiere calcaire Chaetognatha 132 vers marins constituant du zooplancton Chordata 73 501 vertebres amphioxus Cnidaria 15 659 coraux anemone de mer hydres Ctenophora 216 organismes marins ayant des cils locomoteurs Cycliophora 2 organismes marins microscopiques Dicyemida 122 parasites de cephalopodes Echinodermata 11 623 oursins etoiles de mer concombres de mer Entoprocta 171 vers marins Gastrotricha 878 vers marins Gnathostomulida 100 vers marins Hemichordata 139 vers marins Kinorhyncha 344 invertebres marins Loricifera 44 organismes marins microscopiques Micrognathozoa 1 Limnognathia maerski Mollusca 130 560 bivalves escargots pieuvres limaces Nematoda 17 461 vers ronds non segmentes filaire de Bancroft oxyure ascaris Nematomorpha 356 vers non segmentes cylindriques parasites d arthropodes Nemertea 1 373 vers possedant une trompe presque tous marins Onychophora 230 vers a pattes Orthonectida 26 organismes marins Phoronida 19 especes marines Placozoa 4 metazoaires aplatis en forme de plaque Plathelminthes 22 884 vers plats ver solitaire douve du foie planaire Porifera 9 622 eponges Priapulida 22 vers marins possedant une trompe epineuse extensible Rotifera 2 014 organismes aquatiques munis de cils vibratiles Sipuncula 205 vers marins Tardigrada 1 461 tardigrades Xenacoelomorpha 459 vers marins TOTAL 34 1 495 339 Selon l Interim Register of Marine and Nonmarine Genera IRMNG 18 decembre 2024 Acanthocephala Annelida Arthropoda Brachiopoda Bryozoa Cephalorhyncha Chaetognatha Chitinozoa Chordata Cnidaria Ctenophora Cycliophora Cycloneuralia Echinodermata Entoprocta Gastrotricha Gnathostomulida Hemichordata Hyolitha Kinorhyncha Lobopoda Loricifera Micrognathozoa Mollusca Nematoda Nematomorpha Nemertea Onychophora Orthonectida Phoronida Placozoa Platyhelminthes Porifera Priapulida Rhombozoa Rotifera Scalidophora Sipuncula Tardigrada Vendobionta Vetulicolia Xenacoelomorpha Plantes Plantae Une categorie est consacree a ce sujet Division de plantes nom scientifique Selon le Catalogue of Life 1er aout 2023 Plantae est defini au sens large Archaeplastida comprenant les plantes terrestres bryophytes et plantes vasculaires les algues vertes et les algues rouges bryophytes Anthocerotophyta Stotler amp Crand Stotl Bryophyta Schimp Langiophytophyta Doweld Marchantiophyta Stotler amp Crand Stotl algues vertes Charophyta Migula 1897 Chlorophyta Glaucophyta Skuja 1954 algues rouges Rhodophyta plantes vasculaires Tracheophyta Selon la World Flora Online janvier 2024 Plantae est defini au sens strict des plantes terrestres comprenant les bryophytes et les plantes vasculaires sous regne des Bryobiotina Trevis bryophytes Anthocerotophyta Stotler amp Crand Stotl anthocerotes Bryophyta Schimp mousses Marchantiophyta Stotler amp Crand Stotl hepatiques sous regne des Pteridobiotina Britton amp Brown plantes vasculaires Magnoliophyta Cronquist Takht amp W Zimm ex Reveal plantes a fleurs Cycadophyta Bessey cycas Ginkgophyta Bessey ginkgos Lycopodiophyta D H Scott lycophytes Pinophyta Cronquist Takht amp W Zimm ex Reveal coniferes Polypodiophyta Reveal fougeres et autres Selon l IRMNG 18 decembre 2024 Acritarcha Anthocerotophyta Bryophyta Charophyta Chlorophyta Glaucophyta Marchantiophyta Rhodophyta Tracheophyta Champignons Fungi Une categorie est consacree a ce sujet Division de champignons nom scientifique Selon le Catalogue of Life 1er aout 2023 Ascomycota Basidiomycota Blastocladiomycota Chytridiomycota Entomophthoromycota Glomeromycota Mucoromycota Neocallimastigomycota Zoopagomycota Zygomycota Selon l IRMNG 18 decembre 2024 Aphelidiomycota Ascomycota Basidiomycota Blastocladiomycota Chytridiomycota Entomophthoromycota Glomeromycota Rozellomycota Zygomycota Protozoaires Protozoa Selon le Catalogue of Life 1er aout 2023 Amoebozoa G J M Versteegh T Servais M Streng A Munnecke amp D Vachard 2009 Choanozoa Euglenozoa Cavalier Smith 1981 Loukozoa Cavalier Smith 1999 Metamonada Grasse 1952 emend Cavalier Smith 2003 Microsporidia Mycetozoa Sarcomastigophora Sulcozoa Cavalier Smith 2013 Selon l IRMNG 18 decembre 2024 sous regne Eozoa Loukozoa Metamonada Percolozoa Euglenozoa sous regne Sarcomastigota Amoebozoa Choanozoa Sulcozoa Chromistes Chromista Selon le Catalogue of Life 1er aout 2023 Tikhonenkov Janouskovec Mylnikov Mikhailov Simdyanov Aleoshin amp Keeling 2014 Bigyra Cercozoa Ciliophora cilies Cryptista Cavalier Smith 1989 Foraminifera d Orbigny 1826 foraminiferes Haptophyta D J Hibberd ex B Edvardsen amp W Eikrem in Edvardsen et al 2000 Heliozoa Miozoa Ochrophyta algues brunes diatomees Oomycota oomycetes Seenivasan Sausen Medlin amp Melkonian 2013 Radiozoa Selon l IRMNG 18 decembre 2024 sous regne Hacrobia Cryptista Haptophyta Heliozoa sous rene Harosa infra regne Halvaria super embranchement Alveolata Ciliophora Miozoa super embranchement Heterokonta Bacillariophyta Bigyra Ochrophyta Pseudofungi Bigyromonada infra regne Rhizaria Cercozoa Retaria Bacteries Bacteria Une categorie est consacree a ce sujet Phylum de bacteries nom scientifique Article detaille Phyla bacteriens Selon la LPSN 12 avril 2025 le domaine des Bacteria comprend les phyla suivants publies de maniere valide Abditibacteriota Tahon et al 2023 Acidobacteriota Thrash amp Coates 2021 Actinomycetota Goodfellow 2021 Aquificota Reysenbach 2021 Armatimonadota Tamaki et al 2021 Atribacterota Katayama et al 2021 Bacillota Gibbons amp Murray 2021 Bacteroidota Krieg et al 2021 Balneolota Hahnke et al 2021 Caldisericota Mori et al 2021 Calditrichota Kublanov et al 2021 Chlamydiota Garrity amp Holt 2021 Chlorobiota Iino et al 2021 Chloroflexota Garrity amp Holt 2021 Chrysiogenota Garrity amp Holt 2021 Coprothermobacterota Pavan et al 2021 Cyanobacteriota Oren et al 2022 Deferribacterota Garrity amp Holt 2021 Deinococcota Weisburg et al 2021 Dictyoglomerota corrig Patel 2021 Elusimicrobiota Geissinger et al 2021 Fibrobacterota Garrity amp Holt 2021 Fidelibacterota Katayama et al 2024 Fusobacteriota Garrity amp Holt 2021 Gemmatimonadota Zhang et al 2021 Kiritimatiellota Spring et al 2021 Lentisphaerota Cho et al 2021 Minisyncoccota Nakajima et al 2025 Mycoplasmatota Murray 2021 Nitrospinota Lucker et al 2021 Nitrospirota Garrity amp Holt 2021 Planctomycetota Garrity amp Holt 2021 Pseudomonadota Garrity et al 2021 Rhodothermota Munoz et al 2021 Spirochaetota Garrity amp Holt 2021 Synergistota Jumas Bilak et al 2021 Thermodesulfobacteriota Garrity amp Holt 2021 Thermomicrobiota Garrity amp Holt 2021 Thermotogota Reysenbach 2021 Verrucomicrobiota Hedlund 2021 Vulcanimicrobiota Yabe et al 2024 Selon la LPSN 12 avril 2025 le domaine des Bacteria inclut en outre les phyla candidats suivants Ca signifie Candidatus et les guillemets indiquent l absence de statut nomenclatural Ca Acetithermota corrig Rinke et al 2013 Ca Aerophobota corrig Rinke et al 2013 Ca Altimarinota corrig Rinke et al 2013 Ca Aminicenantota corrig Rinke et al 2013 Ca Auribacterota Williams et al 2022 corrig Yeoh et al 2016 Chuvochina et al 2019 Hao et al 2018 Hahn et al 2020 corrig Colman et al 2016 Rinke et al 2013 corrig Rinke et al 2013 Zhang et al 2022 corrig Rinke et al 2013 Rinke et al 2013 Martinez et al 2019 Begmatov et al 2022 Yeoh et al 2016 corrig Ji et al 2017 Williams et al 2022 corrig Rodriguez et al 2020 corrig Kirkegaard et al 2016 corrig Rinke et al 2013 corrig Hernsdorf et al 2017 Zhang et al 2022 Williams et al 2022 corrig Rinke et al 2013 corrig Jungbluth et al 2017 corrig Kantor et al 2015 Youssef et al 2019 corrig Eloe Fadrosh et al 2016 corrig Rinke et al 2013 Williams et al 2022 Nobu et al 2023 corrig Yadav et al 2020 corrig Anantharaman et al 2016 Viljakainen amp Hug 2021 corrig Rinke et al 2013 corrig Sekiguchi et al 2015 corrig Barnum et al 2018 corrig Rinke et al 2013 Rinke et al 2013 corrig Castelle et al 2017 corrig Wrighton et al 2012 Zhang et al 2022 corrig Anantharaman et al 2016 corrig Albertsen et al 2013 Kadnikov et al 2019 corrig Cui et al 2021 corrig Hug et al 2016 Archees Archaea Une categorie est consacree a ce sujet Phylum d archees nom scientifique Selon la LPSN 1er aout 2023 corrig Rinke et al 2013 Aigarchaeota Nunoura et al 2011 Asgardarchaeota Da Cunha et al 2017 corrig Nunoura et al 2011 Liu et al 2021 Liu et al 2021 Rinke et al 2013 Euryarchaeota Garrity amp Holt 2001 Xie et al 2022 Chuvochina et al 2019 McGonigle et al 2019 Liu et al 2021 Liu et al 2021 Probst et al 2018 corrig Probst et al 2018 Jungbluth et al 2017 corrig Rinke et al 2013 Liu et al 2021 Korarchaeota Ludwig amp Klenk 2001 Spang et al 2015 Lokiarchaeota corrig Spang et al 2015 corrig Vanwonterghem et al 2016 Baker amp Dick 2013 Sakai et al 2022 Nanoarchaeota Huber et al 2002 Nanohaloarchaeota Rinke et al 2013 Wang et al 2019 Brochier Armanet et al 2021 Xie et al 2022 Odinarchaeota Zaremba Niedzwiedzka et al 2017 Rinke et al 2013 corrig Rinke et al 2019 Farag et al 2021 Xie et al 2022 Thermoplasmatota Rinke et al 2019 Garrity amp Holt 2021 Dombrowski et al 2020 Vanwonterghem et al 2016 Liu et al 2021 Virus Une categorie est consacree a ce sujet Embranchement de virus Article connexe Classification des virus Selon l International Committee on Taxonomy of Viruses 1er aout 2023 domaine regne domaine Duplodnaviria regne Heunggongvirae domaine Monodnaviria regne regne regne regne Trapavirae Saleviricota domaine Riboviria regne Orthornavirae Kitrinoviricota Negarnaviricota Pisuviricota regne domaine Ribozyviria domaine regne Nucleocytoviricota Preplasmiviricota regne Helvetiavirae DividoviricotaAutres rangs taxonomiquesLes rangs taxonomiques utilises en systematique linneenne pour indiquer la hierarchie entre les taxons nommes dans la classification du monde vivant sont les suivants par ordre decroissant Super regne Empire Domaine Superregnum Imperium Dominium Regne Regnum Sous regne Subregnum Rameau Ramus branch en anglais Infra regne Infraregnum Super embranchement Super division Superphylum Superdivisio Embranchement Division Phylum Divisio Sous embranchement Sous division Subphylum Subdivisio Infra embranchement Infraphylum Micro embranchement Microphylum Super classe Superclassis Classe Classis Sous classe Subclassis Infra classe Infraclassis Super ordre Superordo Ordre Ordo Sous ordre Subordo Infra ordre Infraordo Micro ordre Microordo Super famille Superfamilia Famille Familia Sous famille Subfamilia Super tribu Supertribus Tribu Tribus Sous tribu Subtribus Genre Genus Sous genre Subgenus Section Sectio Sous section Subsectio Espece Species Sous espece subspecies dernier rang zoologique officiel Variete varietas race etant un rang zoologique informel Sous variete subvarietas sous race etant un rang zoologique informel Forme forma dernier rang en mycologie forme etant un rang zoologique informel Sous forme subforma Notes et referencesNotes En gras les sept rangs principaux RECOFGE sigle mnemotechnique pour Regne Embranchement Classe Ordre Famille Genre Espece en maigre les rangs secondaires En romain les noms vulgaires en italique les noms scientifiques Un embranchement en zoologie ou division en botanique est traditionnellement caracterise par une description schematique appelee plan d organisation a b et c Les taxons aux rangs de race et de sous race animaux domestiques principalement n ont pas de nom scientifique Ils ne sont pas regis par le Code international de nomenclature zoologique CINZ References es Cet article est partiellement ou en totalite issu de l article de Wikipedia en espagnol intitule Filo voir la liste des auteurs Atlas de phylogenie la classification du vivant en fiches et en images Dunod coll Sciences sup 2014 ISBN 978 2 10 070445 3 Sur abonnement https international scholarvox com book 88820738 en Michael A Ruggiero Dennis P Gordon Thomas M Orrell Nicolas Bailly Thierry Bourgoin Richard C Brusca Thomas Cavalier Smith Michael D Guiry et Paul M Kirk A Higher Level Classification of All Living Organisms PLOS One PLoS vol 10 no 4 29 avril 2015 e0119248 ISSN 1932 6203 OCLC 228234657 PMID 25923521 PMCID 4418965 DOI 10 1371 JOURNAL PONE 0119248 a et b en James W valentine On the origin of phyla Chicago University of Chicago Press 2004 ISBN 978 0 226 84548 7 lire en ligne de Haeckel Generelle morphologie der organismen Allgemeine grundzuge der organischen formen wissenschaft mechanisch begrundet durch die von Charles Darwin reformirte descendenztheorie Berlin G Reimer 1866 lire en ligne en V N Naik Taxonomy of Angiosperms Tata McGraw Hill 1984 ISBN 978 0 07 451788 8 lire en ligne en Allen Gilbert Collins et Valentine JW Defining phyla evolutionary pathways to metazoan body plans Evolution amp Development Wiley Blackwell vol 3 no 6 1er novembre 2001 p 432 442 ISSN 1520 541X et 1525 142X OCLC 41390326 PMID 11806639 DOI 10 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