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Les bactéries du genre Pseudomonas peuvent être définies par Bacilles à Gram négatif oxydase Aérobies stricts Respiratio

Pseudomonas

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Les bactéries du genre Pseudomonas peuvent être définies par :

  • Bacilles à Gram négatif, oxydase + ;
  • Aérobies stricts (« Respiration nitrate » chez certaines espèces) ;
  • Dégradant le glucose par respiration aérobie ou inerte vis-à-vis du glucose. Ils n'attaquent pas les sucres ou les attaquent par voie oxydative et non fermentative ;
  • Généralement mobiles par ciliature polaire (monotriche ou lophotriche) ;
  • Peu exigeantes, cultivant de 0 à 30 °C ;
  • Indole - ;
  • Asporulés ;
  • Colonies souvent pigmentées.
Pseudomonas
image
Pseudomonas aeruginosa
en coloration de Gram
Classification
Domaine Bacteria
Embranchement Pseudomonadota
Classe Gammaproteobacteria
Ordre Pseudomonadales
Famille Pseudomonadaceae

Genre

Pseudomonas
Migula, 1894

Au début des années 2000, on considère que la famille des Pseudomonacées regroupe probablement la forme de vie la plus abondante et la plus répandue sur la planète. Ce genre comprend en effet plus d'une centaine d'espèces ubiquitaires (dont l'espèce-type est Pseudomonas aeruginosa, généralement appelée Bacille pyocyanique). Cependant, ce nombre se réduit car les progrès de la phylogénétique permettent d'affiner le classement. On tend vers une soixantaine d'espèces.

Habitat

Ces bactéries, largement répandues dans l'environnement, vivent dans le sol et les eaux douces, salées et saumâtres, superficielles et souterraines, et sont y compris retrouvées vivantes pour certaines souches dans les brumes, dans la pluies ou dans les nuages jusqu'à plus de 16 km d'altitude. Elles se retrouvent sur les plantes, dans les matières organiques non vivantes (denrées alimentaires), entraînant, parfois, leur altération organoleptique. L'Homme en a accru les habitats, dont via le transport aérien, maritime et fluvial et jusque dans le sous-sol via la fracturation hydraulique car on la retrouve aussi dans les boues de forages et fluides de fracturation.

Elles se rencontrent chez l'homme ou l'animal au niveau des fosses nasales et dans l'intestin. Elles constituent, pour la plupart, une flore commensale.

Certaines jouent un rôle pathogène :

  • chez les plantes (quelques espèces, dont Pseudomonas syringae, dont une souche tue ou rend malade de jeunes marronniers par milliers depuis le début des années 2000) ;
  • chez l'Homme et l'animal (avec principalement Pseudomonas aeruginosa).

Elles occupent des niches écologiques variées, mais se retrouvent plus particulièrement dans les milieux humides tels que les eaux douces, les eaux de mer, les eaux thermales. Elles se retrouvent en plus petite quantité dans les eaux riches en matières organiques (en particulier les eaux stagnantes) conséquence de la compétition entre microorganismes où les Pseudomonas ne sont pas les plus performants. Dans les habitations, elles se retrouvent ainsi dans les siphons d'évier, les eaux de réservoirs d'eaux de pluie qui, lorsqu'elles sont utilisées pour l'arrosage des plantes, peuvent provoquer des maladies sur les plantes en particulier les fleurs (pour les espèces phytopathogènes).

Spécificités écologiques

Le caractère très ubiquitaire des Pseudomonas est lié à des capacités adaptatives inhabituelles chez les bactéries, leur permettant de rapidement s'adapter à de très nombreux milieux et à des conditions de vies difficiles ; Quelques souches de Pseudomonas aeruginosa comptent parmi les microbes connus pour être les plus résistants aux antibiotiques

  • Leur génome (récemment séquencé : 6,3 Mpb et un contenu en GC de 66 %) est un des plus grands du monde bactérien. Il intègre 5570 cadres de lecture ouverts et contient la plus grande proportion de gènes régulateurs connus. Une batterie de gènes de catabolisme, de transport et d’efflux et de chimiotaxie leur permet de résister à de nombreux facteurs de stress ; elles disposent de plus de 300 systèmes différents de transport de nutriments ;
  • Elles peuvent vivre avec ou sans oxygène (en anaérobiose, elles en utilisent les nitrates comme accepteur final d’électrons), et dans tous les milieux et dans une large gamme de températures et de pressions.
  • Elles disposent de nombreux mécanismes d'alimentation  ;
  • Elles sont activement mobiles ;
  • Elles sont dotées d'au moins 55 protéines kinase détectrices, de 89 facteurs de transcription et de 14 protéines de fusion détectrices/régulatrices ; autant de capteurs et "outils" leur permettant de trouver des sources variées de nutriments (chimiotaxie) ;
  • Leur membrane est résistante (assez bonne résistance face aux UV solaires par exemple), et leur perméabilité membranaire est basse, ce qui renforce leur résistance aux stress externes ;
  • Certaines espèces (P. aeruginosa notamment) sécrètent de puissants composés fongicides leur permettant de résister aux attaques fongiques, tout en accédant à des ressources nutritives sans entrer en compétition avec les champignons ;
  • Elles disposent d'une gamme étendue de porines et de pompes d’efflux leur permettant de contrôler leur milieu interne et d'évacuer vers l'extérieur de nombreuses molécules antibiotiques, perturbatrices ou inutiles (Walsh 2003).
  • Elles disposent d'adhésines, de LPS, d'un système de sécrétion de type III, sécrètent des toxines ExoS et ExoU, de l’élastase et un alginate leur permettant de former des biofilms hautement résistants.

Biodégradation

De nombreuses souches de Pseudomonas jouent un rôle majeur dans les processus de biodégradation. Dans les processus de remédiation et traitement de sites pollués, la biodégradation ou peut être favorisée ou accélérée par des apports en nutriments ou par des souches bactériennes sélectionnées. C'est le cas par exemple pour les pollutions du sol ou de l'eau par du fioul ou du pétrole brut. Dans ce cas un ensemencement par des souches mixtes de Pseudomonas et de Rhodococcus et se sont montrées plus efficaces pour dégrader le fioul en milieu aquatique. Dans ce dernier cas, on n'a pas réussi à améliorer les performances des bactéries en portant l'association à trois, quatre, ou cinq souches d'autres bactéries.
L'association champignon/bactérie est aussi très fréquente pour la dégradation de matières organiques, ou dans certains processus pathogènes (surinfection).

Rôle pathogène

Chez l'Homme, l'espèce Pseudomonas aeruginosa (appelé aussi bacille pyocyanique) intervient fréquemment comme pathogène opportuniste. Elle se retrouve en flore de transit sur la peau et les muqueuses et cause des surinfections de plaies ou brûlures. Chez des individus immunodéprimés elle peut être la cause de diverses infections cutanées et viscérales voire de septicémie. Elle comporte un risque particulièrement élevé d'infections nosocomiales (contractées par l'intermédiaire de soins en milieu hospitalier), notamment avec des souches résistantes à certains antibiotiques courants.

Les autres germes sont peu agressifs par eux-mêmes mais se comportent en général comme germes « opportunistes » profitant de conditions anormales d'implantation chez des individus débilités, créant des flores de substitution ou des infections graves par introduction accidentelle dans l'organisme (cathétérismes, baxter, sondages, etc.). Leur rôle a acquis plus d'importance au cours des dernières années, surtout en milieu hospitalier.

Traitement

Antibiotiques

Pseudomonas aeruginosas est sensible aux fluoroquinolones et ne présente généralement pas de difficulté à être traitée. Toutefois certaines souches deviennent antibiorésistantes. Malheureusement, du fait de leur caractère multirésistant et de l’usage massif d’antibiotiques, ces souches ont été artificiellement sélectionnées par l’homme et peuvent finir par prédominer sur les autres.

Le milieu hospitalier est l’endroit idéal pour cette sélection non désirée et Pseudomonas aeruginosa est responsable de nombreuses infections nosocomiales.

Caractères bactériologiques

Morphologie microscopique

Aspect : les espèces du genre Pseudomonas sont des bacilles Gram négatifs fins droits et très mobiles grâce à un flagelle polaire : ciliature monotriche, dépourvus de spores et de capsules.

Groupement : elles apparaissent la plupart du temps isolés ou en diplobacilles.

Caractères de culture

Conditions de culture

Les espèces du genre Pseudomonas sont des germes peu exigeants, l'immense majorité des espèces n'exigent aucun facteur de croissance et sont capables d'utiliser comme seule source de carbone et d'énergie un large spectre de substrats carbonés simples et variés.

Elles se développent sur tous les milieux usuels, même les plus simples. Elles sont alcalinophiles.

Elles possèdent aussi une grande tolérance dans les gammes de température environnante, bien qu'ayant une température optimale de croissance située entre 30 et 35 °C (mésophile), elles sont capables de se développer à des températures entre 4 et 42 °C en ralentissant leur métabolisme. Leur croissance n'est donc pas totalement entravée par les locaux réfrigérés et les incubateurs.

Elles résistent à de nombreux inhibiteurs bactériens, particulièrement aux agents chimiques. Elles continuent leur développement dans certaines solutions antiseptiques (notamment le ) et sont résistantes à de nombreux antibiotiques.

Milieux de cultures utilisés

  • Milieux non sélectifs
    • Gélose ordinaire
    • Gélose BCP
    • Eau peptonée
  • Milieux sélectifs
    • Gélose cétrimide
    • Milieu de King A
    • Milieu de King B

Matrice d'identification des espèces du genre Pseudomonas

-1= négatif ou absence, caractère absent chez 100%, ou présent chez 0%; 1= positif ou présence, caractère présent chez 100%, ou absent chez 0%; 0 ou espace libre = caractère variable présent chez 50%, ou absence d'information

Genre Espèce Soustype / Observations Oxydase 42 °C (thermophile) 4 °C (cryophile) (pour Fluoresceine = Pyoverdine) (pour Pyocyanine) autre Pigment Poly-Beta-Hydroxy-Butyrate Mobilité ADH = L-Arginin DeHydrogenase NO3 Nitrate réductase (incolor) > Nitrites (rouge) = Collagénase Amylase = Amidon Hydrolase Lécithinase = Réaction au jaune d'œuf Lipase (Hydrolyse de Tween80) NO2 > N2 Cathécol ortho-clivage Procathénuate ortho-clivage Procathénuate méta-clivage Lévane (méta-clivage) production à partir du saccharose D-Glucose assimilation D-Tréhalose assimilation Saccharose assimilation Propionate assimilation Butyrate assimilation D-Sorbitol assimilation Adonitol assimilation Méso-Inositol assimilation Géraniol assimilation L-Valine assimilation D-Alanine assimilation L-Arginine assimilation Arginine Hydrolyse = (Béta-glucosidase) Citrate de Simmons Citrate trisodique assimilation D-Glucose fermentation D-Glucose assimilation
Pseudomonas sp 0,99 0,9 -0,68 -1 -1 -1 -0,86
Pseudomonas aeruginosa 0,97 0,9 -1 0,9 0,9 pyomélanine = brun noir ou acajou; pyorubine = aeruginosine A=rouge de nature phénazinique -1 0,94 0,7 0,92 0,84 -0,9 -0,9 0,1 0,9 0,9 0,9 -0,9 -0,9 0,98 -1 -1 0,9 0,9 -0,9 -1 -0,9 0,9 0,1 0,9 0,9 -0,98 0,98 -0,38 0,98
Pseudomonas fluorescens I 0,99 -1 0,98 0,9 -0,9 -0,9 -0,9 1 0,35 -0,46 0,4 -0,9 0,9 0,1 0,9 0,9 0,9 -0,9 0,9 0,98 1 0,9 0,9 -0,9 0,01 0,01 0,9 -0,9 0,9 0,9 0,9 -0,98 0,98 -0,75 0,98
Pseudomonas putida 0,98 -1 0,7 0,7 -0,9 -0,9 -0,9 1 0,76 -0,94 -1 -0,9 -0,9 0,2 0,9 0,9 0,9 -0,9 -0,9 0,9 -1 -0,6 0,9 0,9 -0,7 -0,9 -0,9 -0,9 0,9 0,9 0,9 -1 0,98 -0,8 0,9
Pseudomonas agarici sans intérêt médical, phytopathogèn 0,99 0,9
Pseudomonas alcaligenes sans intérêt médical 0,97 0,9 -1 -0,9 -0,9 jaune-orange (caroténoïde) -0,9 0,9 0,2 0,7 -0,01 -0,9 -0,9 0,2 0,9 -0,9 -0,8 -1 0,9 0,2 -0,9 -0,9 -0,9 -0,9 0,2 0,9 -1 0,2 -1 -0,8
Pseudomonas amygdali sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas anguiliseptica sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas asplenii sans intérêt médical, phytopathogèn 0,99 0,9
Pseudomonas balearica 0,99 0,9 -0,48 0,9 -0,98 -1 1 -1 1 1 1 0,5
Pseudomonas caricapapayae sans intérêt médical 0,99 0,9 -0,48 0,9 -0,98 -1 1 1 1 -1 1 1 1 0,5
Pseudomonas chlororaphis sans intérêt médical 0,99 -1 0,7 0,2 -0,9 chlororaphine (pigment vert = réduit et jaune = oxydé) -0,9 0,9 0,9 0,9 0,9 -0,9 0,9 0,9 0,9 0,9 0,9 -0,9 0,9 0,9 1 0,9 0,9 0,9 -0,9 -0,9 0,9 -0,9 0,9 0,9 0,9 0,9
Pseudomonas cichorii sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas citronellolis sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas coronafaciens sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas corrugata sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas ficuserectae sans intérêt médical, phytopathogèn 0,99 0,9
Pseudomonas flavescens sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas fragi sans intérêt médical, sur viande avariée 0,99 0,9 -0,9 -1 1 1 1 1 1
Pseudomonas fuscovaginae sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas lundunensi sans intérêt médical, psychrotrophe isolé du viande 0,99 0,9
Pseudomonas marginalis sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas meliae sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas mendocina col pigm brun-jaune = pigment caroténoïde intracellulaire 0,99 0,9 -1 -0,9 -0,9 jaune-orange (caroténoïde) -0,9 0,9 0,88 1 -1 -0,9 -0,9 0,9 0,9 0,9 -0,9 0,9 -1 0,9 0,9 -1 -0,9 0,9 0,9 0,9 0,9 -1 1 -0,01 0,9
Pseudomonas mucidolens sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas oleovorans sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas stutzeri ubiquitaire 0,99 0,9 -1 -0,9 -0,9 -0,9 -0,9 0,9 -0,98 0,88 -0,21 -0,9 0,9 -0,9 0,9 0,9 0,9 -0,9 0,96 -1 0,2 0,9 -0,9 -0,9 -0,9 0,9 0,9 -0,9 -1 0,7 0,21 0,96
Pseudomonas pseudoalcaligenes 0,99 0,9 -1 -0,9 -0,9 -0,9 0,2 0,9 0,7 0,2 0,2 -0,9 -0,9 -0,9 0,9 -0,9 -0,9 -1 0,9 0,9 0,2 -0,9 -0,9 -0,9 0,2 0,9 -1 -0,9
Pseudomonas resinovorans sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas savastanoi sans intérêt médical, phytopathogène de l'Olivier 0,99 0,9 1 -1 1 -1 0,44
Pseudomonas stanieri sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas rhodesiae dans les eaux minérales 0,99 0,9
Pseudomonas jessenii dans les eaux minérales 0,99 0,9
Pseudomonas mandelii dans les eaux minérales 0,99 0,9 -0,48 -0,9 -0,98 -1 1 1 -1 -1 1 1 1 0,5
Pseudomonas gessardii dans les eaux minérales 0,99 0,9
Pseudomonas migulaï dans les eaux minérales 0,99 0,9
Pseudomonas libanensis dans les eaux de source libanaises 0,99 0,9 0,3 -1 1 1 -1 -1 -1 1
Pseudomonas cedrella dans les eaux de source libanaises 0,99 0,9
Pseudomonas orientalis dans les eaux de source libanaises 0,99 0,9 -0,9 1 1 -1 -1 1 1 -1
Pseudomonas syringae sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas avellanae sans intérêt médical 0,99 0,9 -0,48 0,9 -0,98 -1 -1 1 1 -1 1 1 1 0,5
Pseudomonas taetrolens sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas tolaasii sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas viridiflava sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas aureofaciens sans intérêt médical 0,99 -1 0,7 0,9 -0,9 orange = phénazine-1-carboxylate -0,9 0,9 0,9 -0,48 0,9 -0,98 0,2 0,2 0,9 0,9 0,9 -0,9 0,9 0,2 0 0,2 1 -0,5 -1 -1 1 -1 1 0,01 1 0,5 0,2
Pseudomonas sacharophila sans intérêt médical 0,99 0,9
Pseudomonas veronii dans les eaux minérales 0,99 0,9
Pseudomonas tomato 0,99 0,9
Pseudomonas glycinea 0,99 0,9
Pseudomonas phaseolicola 0,99 0,9
Pseudomonas fluorescens II 0,99 -1 0,98 0,1 -0,9 -0,9 -0,9 0,9 0,9 -0,46 0,6 -0,9 0,3 -0,9 0,9 0,9 0,9 -0,9 0,9 0,9 1 0,9 0,9 0,1 1 -1 0,9 -0,9 0,9 0,9 0,9 -0,98 0,98 -0,75 0,9
Pseudomonas fluorescens III 0,99 -1 0,98 0,9 -0,9 -0,9 -0,9 0,9 0,9 -0,46 -0,22 -0,9 0,9 0,1 0,9 0,9 0,9 -0,9 -0,9 0,9 1 -0,9 0,1 0,1 0,1 0,1 0,9 -0,9 0,9 0,9 0,9 -0,98 0,98 -0,75 0,9
Pseudomonas fluorescens IV 0,99 -1 0,98 0,9 -0,9 -0,9 -0,9 0,9 0,9 -0,46 0,9 -0,89 0,9 0,1 0,9 0,9 0,9 -0,9 0,9 0,9 1 0,9 0,9 0,9 0,9 -0,9 0,9 -0,9 1 1 1 -0,98 0,98 -0,75 0,9
Pseudomonas fluorescens V 0,99 -1 0,5 0,1 -0,9 -0,9 -0,9 0,9 0,9 -0,46 0,9 -0,9 0,1 0,1 0,9 0,9 0,9 -0,9 -0,9 0,98 1 0,1 0,9 0,1 0,1 0,2 0,9 -0,9 0,9 -0,9 0,9 -0,98 0,98 -0,75 0,98
Pseudomonas monteilli 0,99 -1 -0,9 0,9 -0,9 -0,9 -0,9 0,9 0,9 -0,9 -0,9 -0,9 -0,9 -0,9 -0,9 0,9 -1 -0,9 0,9 0,9 -0,9 -1 0,9 0,9 0,9 1 0,9

Métabolisme

Presque toutes les espèces possèdent une oxydase (voir le tableau).

La dégradation du glucose s'effectue par la voie d'Entner-Doudoroff, cette propriété est mise en évidence sur milieu Hugh-Leifson. Ils possèdent fréquemment une arginine dihydrolase permettant la dégradation de l'arginine en anaérobiose.

Certaines espèces peuvent extraire l'oxygène libéré par la réduction des nitrates en azote, et ainsi croître en anaérobiose ; on parle alors de « Respiration nitrate ».

Certaines espèces ou souches de pseudomonas produisent de l'acétone (toxique).

En 2025, une équipe de chercheurs allemands annonce qu'après avoir génétiquement modifié des Pseudomonas putida, elles peuvent métaboliser des polyamides pour les transformer en polyesters biodégradables.

Production de pigments

De nombreux représentants de ce genre produisent des pigments. Citons ceux utilisés pour l'identification :

  • La pyocyanine, pigment bleu - vert phénazinique, soluble dans le chloroforme et l'eau est spécifique de P. aeruginosa.
  • La pyoverdine, vert fluorescent, soluble dans l'eau, est synthétisée par les Pseudomonas du groupe fluorescent.

Espèces appartenant au genre Pseudomonas

  • Pseudomonas abietaniphila
  • Pseudomonas aeruginosa
  • Pseudomonas cichorii
  • Pseudomonas corrugata
  • Pseudomonas fluorescens
  • Pseudomonas fuscovaginae
  • Pseudomonas savastanoi
  • Pseudomonas syringae
  • Pseudomonas umsongensis

Liste des espèces qui devraient être exclues du genre Pseudomonas :

  • Pseudomonas beijerinckii
  • Pseudomonas beteli
  • Pseudomonas boreopolis
  • Pseudomonas carboxydohydrogena
  • Pseudomonas cissicola
  • Pseudomonas flectens
  • Pseudomonas geniculata
  • Pseudomonas halophila
  • Pseudomonas hibiscicola
  • Pseudomonas mephitica
  • Pseudomonas pictorum

Notes et références

  1. Pitt T.L (2002) "Cross infection of cystic fibrosis patients with Pseudomonas aeruginosa." Thorax 57(11): 921
  2. Cluff, M. A., Hartsock, A., MacRae, J. D., Carter, K., & Mouser, P. J. (2014) Temporal changes in microbial ecology and geochemistry in produced water from hydraulically fractured Marcellus Shale gas wells. Environmental science & technology, 48(11), 6508-6517
  3. Hancock, R. E. and F. S. Brinkman (2002) "Function of pseudomonas porins in uptake and efflux." Annu Rev Microbiol 56: 17-38.
  4. ↑ a b c d e et fParadis-Bleau, C. (2003). Développement accéléré de nouveaux inhibiteurs contre les protéines de division cellulaire FtsZ et FtsA de Pseudomonas aeruginosa., mémoire de maîtrise microbiologie-immunologie pour l’obtention du grade de maître ès sciences (M. Sc.), Université Laval
  5. Stover, C & al. (2000) "Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PA01, an opportunistic pathogen." Nature 406(6799): 959-64
  6. Galli, E., S. Silver, B. Witholt & Federation of European Microbiological Societies (1992) Pseudomonas : molecular biology and biotechnology. Washington, D.C., American Society for Microbiology.
  7. Salyers, A. A. and D. D. Whitt (2002) Bacterial pathogenesis : a molecular approach. Washington, D.C., ASM Press
  8. L. M. Baryshnikova, V. G. Grishchenkov, M. U. Arinbasarov, A. N. Shkidchenko and L. M. Boronin, Biodegradation of Oil Products by Individual Degrading Strains and Their Associations in Liquid Media, Applied Biochemistry and Microbiology Volume 37, Number 5, 463-468, DOI: 10.1023/A:1010285705353
  9. Kekacs, D., Drollette, B. D., Brooker, M., Plata, D. L., & Mouser, P. J. (2015). Aerobic biodegradation of organic compounds in hydraulic fracturing fluids. Biodegradation, 26(4), 271-287. (résumé).
  10. « Des bactéries OGM recyclent le nylon », Sciences et Avenir, no 938,‎ avril 2025, p. 14

Voir aussi

Liens externes

  • (fr) « L P S N »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?)
  • (fr) « Thèse »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?) Diversité fonctionnelle des Pseudomonas producteurs d'antibiotiques dans les rhizosphères de conifères en pépinières et en milieu naturel, par Mathieu Allaire, mai 2005.
  • (en)« http://www.genome.jp/kegg-bin/KEGG_Genome_map_top.pl?org_id=pae »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?) Génome de Pseudomonas aeruginosa PAO1 (pointer sur la barre grise)]
  • image Portail de la microbiologie

Auteur: www.NiNa.Az

Date de publication: 25 Mai, 2025 / 17:28

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Les bacteries du genre Pseudomonas peuvent etre definies par Bacilles a Gram negatif oxydase Aerobies stricts Respiration nitrate chez certaines especes Degradant le glucose par respiration aerobie ou inerte vis a vis du glucose Ils n attaquent pas les sucres ou les attaquent par voie oxydative et non fermentative Generalement mobiles par ciliature polaire monotriche ou lophotriche Peu exigeantes cultivant de 0 a 30 C Indole Asporules Colonies souvent pigmentees Pseudomonas Pseudomonas aeruginosa en coloration de GramClassificationDomaine BacteriaEmbranchement PseudomonadotaClasse GammaproteobacteriaOrdre PseudomonadalesFamille Pseudomonadaceae GenrePseudomonas Migula 1894 Au debut des annees 2000 on considere que la famille des Pseudomonacees regroupe probablement la forme de vie la plus abondante et la plus repandue sur la planete Ce genre comprend en effet plus d une centaine d especes ubiquitaires dont l espece type est Pseudomonas aeruginosa generalement appelee Bacille pyocyanique Cependant ce nombre se reduit car les progres de la phylogenetique permettent d affiner le classement On tend vers une soixantaine d especes HabitatCes bacteries largement repandues dans l environnement vivent dans le sol et les eaux douces salees et saumatres superficielles et souterraines et sont y compris retrouvees vivantes pour certaines souches dans les brumes dans la pluies ou dans les nuages jusqu a plus de 16 km d altitude Elles se retrouvent sur les plantes dans les matieres organiques non vivantes denrees alimentaires entrainant parfois leur alteration organoleptique L Homme en a accru les habitats dont via le transport aerien maritime et fluvial et jusque dans le sous sol via la fracturation hydraulique car on la retrouve aussi dans les boues de forages et fluides de fracturation Elles se rencontrent chez l homme ou l animal au niveau des fosses nasales et dans l intestin Elles constituent pour la plupart une flore commensale Certaines jouent un role pathogene chez les plantes quelques especes dont Pseudomonas syringae dont une souche tue ou rend malade de jeunes marronniers par milliers depuis le debut des annees 2000 chez l Homme et l animal avec principalement Pseudomonas aeruginosa Elles occupent des niches ecologiques variees mais se retrouvent plus particulierement dans les milieux humides tels que les eaux douces les eaux de mer les eaux thermales Elles se retrouvent en plus petite quantite dans les eaux riches en matieres organiques en particulier les eaux stagnantes consequence de la competition entre microorganismes ou les Pseudomonas ne sont pas les plus performants Dans les habitations elles se retrouvent ainsi dans les siphons d evier les eaux de reservoirs d eaux de pluie qui lorsqu elles sont utilisees pour l arrosage des plantes peuvent provoquer des maladies sur les plantes en particulier les fleurs pour les especes phytopathogenes Specificites ecologiquesLe caractere tres ubiquitaire des Pseudomonas est lie a des capacites adaptatives inhabituelles chez les bacteries leur permettant de rapidement s adapter a de tres nombreux milieux et a des conditions de vies difficiles Quelques souches de Pseudomonas aeruginosa comptent parmi les microbes connus pour etre les plus resistants aux antibiotiques Leur genome recemment sequence 6 3 Mpb et un contenu en GC de 66 est un des plus grands du monde bacterien Il integre 5570 cadres de lecture ouverts et contient la plus grande proportion de genes regulateurs connus Une batterie de genes de catabolisme de transport et d efflux et de chimiotaxie leur permet de resister a de nombreux facteurs de stress elles disposent de plus de 300 systemes differents de transport de nutriments Elles peuvent vivre avec ou sans oxygene en anaerobiose elles en utilisent les nitrates comme accepteur final d electrons et dans tous les milieux et dans une large gamme de temperatures et de pressions Elles disposent de nombreux mecanismes d alimentation Elles sont activement mobiles Elles sont dotees d au moins 55 proteines kinase detectrices de 89 facteurs de transcription et de 14 proteines de fusion detectrices regulatrices autant de capteurs et outils leur permettant de trouver des sources variees de nutriments chimiotaxie Leur membrane est resistante assez bonne resistance face aux UV solaires par exemple et leur permeabilite membranaire est basse ce qui renforce leur resistance aux stress externes Certaines especes P aeruginosa notamment secretent de puissants composes fongicides leur permettant de resister aux attaques fongiques tout en accedant a des ressources nutritives sans entrer en competition avec les champignons Elles disposent d une gamme etendue de porines et de pompes d efflux leur permettant de controler leur milieu interne et d evacuer vers l exterieur de nombreuses molecules antibiotiques perturbatrices ou inutiles Walsh 2003 Elles disposent d adhesines de LPS d un systeme de secretion de type III secretent des toxines ExoS et ExoU de l elastase et un alginate leur permettant de former des biofilms hautement resistants BiodegradationDe nombreuses souches de Pseudomonas jouent un role majeur dans les processus de biodegradation Dans les processus de remediation et traitement de sites pollues la biodegradation ou peut etre favorisee ou acceleree par des apports en nutriments ou par des souches bacteriennes selectionnees C est le cas par exemple pour les pollutions du sol ou de l eau par du fioul ou du petrole brut Dans ce cas un ensemencement par des souches mixtes de Pseudomonas et de Rhodococcus et se sont montrees plus efficaces pour degrader le fioul en milieu aquatique Dans ce dernier cas on n a pas reussi a ameliorer les performances des bacteries en portant l association a trois quatre ou cinq souches d autres bacteries L association champignon bacterie est aussi tres frequente pour la degradation de matieres organiques ou dans certains processus pathogenes surinfection Role pathogeneChez l Homme l espece Pseudomonas aeruginosa appele aussi bacille pyocyanique intervient frequemment comme pathogene opportuniste Elle se retrouve en flore de transit sur la peau et les muqueuses et cause des surinfections de plaies ou brulures Chez des individus immunodeprimes elle peut etre la cause de diverses infections cutanees et viscerales voire de septicemie Elle comporte un risque particulierement eleve d infections nosocomiales contractees par l intermediaire de soins en milieu hospitalier notamment avec des souches resistantes a certains antibiotiques courants Les autres germes sont peu agressifs par eux memes mais se comportent en general comme germes opportunistes profitant de conditions anormales d implantation chez des individus debilites creant des flores de substitution ou des infections graves par introduction accidentelle dans l organisme catheterismes baxter sondages etc Leur role a acquis plus d importance au cours des dernieres annees surtout en milieu hospitalier TraitementAntibiotiques Pseudomonas aeruginosas est sensible aux fluoroquinolones et ne presente generalement pas de difficulte a etre traitee Toutefois certaines souches deviennent antibioresistantes Malheureusement du fait de leur caractere multiresistant et de l usage massif d antibiotiques ces souches ont ete artificiellement selectionnees par l homme et peuvent finir par predominer sur les autres Le milieu hospitalier est l endroit ideal pour cette selection non desiree et Pseudomonas aeruginosa est responsable de nombreuses infections nosocomiales Caracteres bacteriologiquesMorphologie microscopique Aspect les especes du genre Pseudomonas sont des bacilles Gram negatifs fins droits et tres mobiles grace a un flagelle polaire ciliature monotriche depourvus de spores et de capsules Groupement elles apparaissent la plupart du temps isoles ou en diplobacilles Caracteres de culture Conditions de culture Les especes du genre Pseudomonas sont des germes peu exigeants l immense majorite des especes n exigent aucun facteur de croissance et sont capables d utiliser comme seule source de carbone et d energie un large spectre de substrats carbones simples et varies Elles se developpent sur tous les milieux usuels meme les plus simples Elles sont alcalinophiles Elles possedent aussi une grande tolerance dans les gammes de temperature environnante bien qu ayant une temperature optimale de croissance situee entre 30 et 35 C mesophile elles sont capables de se developper a des temperatures entre 4 et 42 C en ralentissant leur metabolisme Leur croissance n est donc pas totalement entravee par les locaux refrigeres et les incubateurs Elles resistent a de nombreux inhibiteurs bacteriens particulierement aux agents chimiques Elles continuent leur developpement dans certaines solutions antiseptiques notamment le et sont resistantes a de nombreux antibiotiques Milieux de cultures utilises Milieux non selectifs Gelose ordinaire Gelose BCP Eau peptonee Milieux selectifs Gelose cetrimide Milieu de King A Milieu de King BMatrice d identification des especes du genre Pseudomonas 1 negatif ou absence caractere absent chez 100 ou present chez 0 1 positif ou presence caractere present chez 100 ou absent chez 0 0 ou espace libre caractere variable present chez 50 ou absence d information Genre Espece Soustype Observations Oxydase 42 C thermophile 4 C cryophile pour Fluoresceine Pyoverdine pour Pyocyanine autre Pigment Poly Beta Hydroxy Butyrate Mobilite ADH L Arginin DeHydrogenase NO3 Nitrate reductase incolor gt Nitrites rouge Collagenase Amylase Amidon Hydrolase Lecithinase Reaction au jaune d œuf Lipase Hydrolyse de Tween80 NO2 gt N2 Cathecol ortho clivage Procathenuate ortho clivage Procathenuate meta clivage Levane meta clivage production a partir du saccharose D Glucose assimilation D Trehalose assimilation Saccharose assimilation Propionate assimilation Butyrate assimilation D Sorbitol assimilation Adonitol assimilation Meso Inositol assimilation Geraniol assimilation L Valine assimilation D Alanine assimilation L Arginine assimilation Arginine Hydrolyse Beta glucosidase Citrate de Simmons Citrate trisodique assimilation D Glucose fermentation D Glucose assimilationPseudomonas sp 0 99 0 9 0 68 1 1 1 0 86Pseudomonas aeruginosa 0 97 0 9 1 0 9 0 9 pyomelanine brun noir ou acajou pyorubine aeruginosine A rouge de nature phenazinique 1 0 94 0 7 0 92 0 84 0 9 0 9 0 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 98 1 1 0 9 0 9 0 9 1 0 9 0 9 0 1 0 9 0 9 0 98 0 98 0 38 0 98Pseudomonas fluorescens I 0 99 1 0 98 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 35 0 46 0 4 0 9 0 9 0 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 98 1 0 9 0 9 0 9 0 01 0 01 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 98 0 98 0 75 0 98Pseudomonas putida 0 98 1 0 7 0 7 0 9 0 9 0 9 1 0 76 0 94 1 0 9 0 9 0 2 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 6 0 9 0 9 0 7 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 98 0 8 0 9Pseudomonas agarici sans interet medical phytopathogen 0 99 0 9Pseudomonas alcaligenes sans interet medical 0 97 0 9 1 0 9 0 9 jaune orange carotenoide 0 9 0 9 0 2 0 7 0 01 0 9 0 9 0 2 0 9 0 9 0 8 1 0 9 0 2 0 9 0 9 0 9 0 9 0 2 0 9 1 0 2 1 0 8Pseudomonas amygdali sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas anguiliseptica sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas asplenii sans interet medical phytopathogen 0 99 0 9Pseudomonas balearica 0 99 0 9 0 48 0 9 0 98 1 1 1 1 1 1 0 5Pseudomonas caricapapayae sans interet medical 0 99 0 9 0 48 0 9 0 98 1 1 1 1 1 1 1 1 0 5Pseudomonas chlororaphis sans interet medical 0 99 1 0 7 0 2 0 9 chlororaphine pigment vert reduit et jaune oxyde 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9Pseudomonas cichorii sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas citronellolis sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas coronafaciens sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas corrugata sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas ficuserectae sans interet medical phytopathogen 0 99 0 9Pseudomonas flavescens sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas fragi sans interet medical sur viande avariee 0 99 0 9 0 9 1 1 1 1 1 1Pseudomonas fuscovaginae sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas lundunensi sans interet medical psychrotrophe isole du viande 0 99 0 9Pseudomonas marginalis sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas meliae sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas mendocina col pigm brun jaune pigment carotenoide intracellulaire 0 99 0 9 1 0 9 0 9 jaune orange carotenoide 0 9 0 9 0 88 1 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 9 0 9 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 1 0 01 0 9Pseudomonas mucidolens sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas oleovorans sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas stutzeri ubiquitaire 0 99 0 9 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 98 0 88 0 21 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 96 1 0 2 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 7 0 21 0 96Pseudomonas pseudoalcaligenes 0 99 0 9 1 0 9 0 9 0 9 0 2 0 9 0 7 0 2 0 2 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 9 0 9 0 2 0 9 0 9 0 9 0 2 0 9 1 0 9Pseudomonas resinovorans sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas savastanoi sans interet medical phytopathogene de l Olivier 0 99 0 9 1 1 1 1 0 44Pseudomonas stanieri sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas rhodesiae dans les eaux minerales 0 99 0 9Pseudomonas jessenii dans les eaux minerales 0 99 0 9Pseudomonas mandelii dans les eaux minerales 0 99 0 9 0 48 0 9 0 98 1 1 1 1 1 1 1 1 0 5Pseudomonas gessardii dans les eaux minerales 0 99 0 9Pseudomonas migulai dans les eaux minerales 0 99 0 9Pseudomonas libanensis dans les eaux de source libanaises 0 99 0 9 0 3 1 1 1 1 1 1 1Pseudomonas cedrella dans les eaux de source libanaises 0 99 0 9Pseudomonas orientalis dans les eaux de source libanaises 0 99 0 9 0 9 1 1 1 1 1 1 1Pseudomonas syringae sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas avellanae sans interet medical 0 99 0 9 0 48 0 9 0 98 1 1 1 1 1 1 1 1 0 5Pseudomonas taetrolens sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas tolaasii sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas viridiflava sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas aureofaciens sans interet medical 0 99 1 0 7 0 9 0 9 orange phenazine 1 carboxylate 0 9 0 9 0 9 0 48 0 9 0 98 0 2 0 2 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 2 0 0 2 1 0 5 1 1 1 1 1 0 01 1 0 5 0 2Pseudomonas sacharophila sans interet medical 0 99 0 9Pseudomonas veronii dans les eaux minerales 0 99 0 9Pseudomonas tomato 0 99 0 9Pseudomonas glycinea 0 99 0 9Pseudomonas phaseolicola 0 99 0 9Pseudomonas fluorescens II 0 99 1 0 98 0 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 46 0 6 0 9 0 3 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 9 0 9 0 1 1 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 98 0 98 0 75 0 9Pseudomonas fluorescens III 0 99 1 0 98 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 46 0 22 0 9 0 9 0 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 9 0 1 0 1 0 1 0 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 98 0 98 0 75 0 9Pseudomonas fluorescens IV 0 99 1 0 98 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 46 0 9 0 89 0 9 0 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 1 1 0 98 0 98 0 75 0 9Pseudomonas fluorescens V 0 99 1 0 5 0 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 46 0 9 0 9 0 1 0 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 98 1 0 1 0 9 0 1 0 1 0 2 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 98 0 98 0 75 0 98Pseudomonas monteilli 0 99 1 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 9 0 9 0 9 0 9 1 0 9 0 9 0 9 1 0 9Metabolisme Presque toutes les especes possedent une oxydase voir le tableau La degradation du glucose s effectue par la voie d Entner Doudoroff cette propriete est mise en evidence sur milieu Hugh Leifson Ils possedent frequemment une arginine dihydrolase permettant la degradation de l arginine en anaerobiose Certaines especes peuvent extraire l oxygene libere par la reduction des nitrates en azote et ainsi croitre en anaerobiose on parle alors de Respiration nitrate Certaines especes ou souches de pseudomonas produisent de l acetone toxique En 2025 une equipe de chercheurs allemands annonce qu apres avoir genetiquement modifie des Pseudomonas putida elles peuvent metaboliser des polyamides pour les transformer en polyesters biodegradables Production de pigments De nombreux representants de ce genre produisent des pigments Citons ceux utilises pour l identification La pyocyanine pigment bleu vert phenazinique soluble dans le chloroforme et l eau est specifique de P aeruginosa La pyoverdine vert fluorescent soluble dans l eau est synthetisee par les Pseudomonas du groupe fluorescent Especes appartenant au genre PseudomonasPseudomonas abietaniphila Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas cichorii Pseudomonas corrugata Pseudomonas fluorescens Pseudomonas fuscovaginae Pseudomonas savastanoi Pseudomonas syringae Pseudomonas umsongensis Liste des especes qui devraient etre exclues du genre Pseudomonas Pseudomonas beijerinckii Pseudomonas beteli Pseudomonas boreopolis Pseudomonas carboxydohydrogena Pseudomonas cissicola Pseudomonas flectens Pseudomonas geniculata Pseudomonas halophila Pseudomonas hibiscicola Pseudomonas mephitica Pseudomonas pictorumNotes et referencesPitt T L 2002 Cross infection of cystic fibrosis patients with Pseudomonas aeruginosa Thorax 57 11 921 Cluff M A Hartsock A MacRae J D Carter K amp Mouser P J 2014 Temporal changes in microbial ecology and geochemistry in produced water from hydraulically fractured Marcellus Shale gas wells Environmental science amp technology 48 11 6508 6517 Hancock R E and F S Brinkman 2002 Function of pseudomonas porins in uptake and efflux Annu Rev Microbiol 56 17 38 a b c d e et f Paradis Bleau C 2003 Developpement accelere de nouveaux inhibiteurs contre les proteines de division cellulaire FtsZ et FtsA de Pseudomonas aeruginosa memoire de maitrise microbiologie immunologie pour l obtention du grade de maitre es sciences M Sc Universite Laval Stover C amp al 2000 Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa PA01 an opportunistic pathogen Nature 406 6799 959 64 Galli E S Silver B Witholt amp Federation of European Microbiological Societies 1992 Pseudomonas molecular biology and biotechnology Washington D C American Society for Microbiology Salyers A A and D D Whitt 2002 Bacterial pathogenesis a molecular approach Washington D C ASM Press L M Baryshnikova V G Grishchenkov M U Arinbasarov A N Shkidchenko and L M Boronin Biodegradation of Oil Products by Individual Degrading Strains and Their Associations in Liquid Media Applied Biochemistry and Microbiology Volume 37 Number 5 463 468 DOI 10 1023 A 1010285705353 Kekacs D Drollette B D Brooker M Plata D L amp Mouser P J 2015 Aerobic biodegradation of organic compounds in hydraulic fracturing fluids Biodegradation 26 4 271 287 resume Des bacteries OGM recyclent le nylon Sciences et Avenir no 938 avril 2025 p 14Voir aussiLiens externes fr L P S N Archive org Wikiwix Archive is Google Que faire fr These Archive org Wikiwix Archive is Google Que faire Diversite fonctionnelle des Pseudomonas producteurs d antibiotiques dans les rhizospheres de coniferes en pepinieres et en milieu naturel par Mathieu Allaire mai 2005 en http www genome jp kegg bin KEGG Genome map top pl org id pae Archive org Wikiwix Archive is Google Que faire Genome de Pseudomonas aeruginosa PAO1 pointer sur la barre grise Portail de la microbiologie

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